More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0342 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0342  integrase family protein  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0330  integrase family protein  47.34 
 
 		 193 aa  181  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1536  phage integrase  43.72 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2340  phage integrase family protein  43.41 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0178  phage integrase family protein  36.5 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2725  integrase family protein  41.84 
 
 		 195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4683  integrase family protein  35.5 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  32.54 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  34.1 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0157  phage integrase family site specific recombinase  30.94 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  29.56 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0195  phage integrase family protein  27.35 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  27.69 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.57 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  29.56 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  35.9 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.56 
 
 		 302 aa  68.6  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  32.89 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.86 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  34.78 
 
 		 443 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.62 
 
 		 299 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.62 
 
 		 299 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.62 
 
 		 299 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.12 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  34.01 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.65 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.69 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  34.67 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2367  phage integrase family protein  32.09 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.683007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.65 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  35.06 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  33.97 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  34.42 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  34.93 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  34 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  32.8 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  35.46 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  32.18 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  36.2 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  35.71 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  33.12 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.28 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  32.41 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  32.12 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  30.52 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.52 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  30.81 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  25.95 
 
 		 328 aa  62  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  32.12 
 
 		 296 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  29.52 
 
 		 296 aa  62  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  31.25 
 
 		 334 aa  62  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 318 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  38.27 
 
 		 309 aa  62  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.18 
 
 		 298 aa  62  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  32.88 
 
 		 305 aa  62  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 299 aa  62  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 311 aa  62  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  31.33 
 
 		 367 aa  62  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  33.99 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  32.26 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  29.15 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.65 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.28 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0585  integrase family protein  31.93 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.65 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  42.17 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  32.03 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.08 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.65 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  29.31 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  35.37 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  36.36 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  33.52 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>