More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0195 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0195  phage integrase family protein  100 
 
 		 231 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_240  site-specific recombinase, phage integrase family  74.46 
 
 		 231 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0157  phage integrase family site specific recombinase  59.57 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  30.56 
 
 		 332 aa  89.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.41 
 
 		 325 aa  88.6  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  31.47 
 
 		 362 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  29.91 
 
 		 353 aa  86.3  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 345 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  30.4 
 
 		 346 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.96 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  30.26 
 
 		 308 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.63 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  28.5 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.28 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  29.19 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  29.05 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.17 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  28.1 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.17 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 		 314 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.6 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  30.7 
 
 		 313 aa  78.2  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.7 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  28.3 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  29.11 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  30.54 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  30.26 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  29.72 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  30.74 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  27.51 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  30.74 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  27.56 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  29 
 
 		 302 aa  75.1  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.82 
 
 		 295 aa  75.1  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  30.29 
 
 		 299 aa  75.1  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  28.7 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  27.9 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  30.48 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.52 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  32.51 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  28.7 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  25.11 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  28.31 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  28.32 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  29.13 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1555  tyrosine recombinase XerD  27.62 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 296 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  32.47 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0342  integrase family protein  27.35 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  27.59 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.51 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1536  phage integrase  27.67 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  30.62 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.47 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  28.07 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  27.16 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  29.61 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  35.16 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  30 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  31.16 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  29.27 
 
 		 299 aa  68.2  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.5 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 313 aa  68.2  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  27.91 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  28.07 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 309 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  28.92 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  30.29 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.19 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  27.71 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  28 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.41 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  28.5 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  26.5 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  27.54 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  28.07 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.92 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  26.79 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>