183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4683 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010000  Sbal195_4683  integrase family protein  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0178  phage integrase family protein  87.62 
 
 		 210 aa  380  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1536  phage integrase  37.93 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0330  integrase family protein  37.88 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0342  integrase family protein  35.5 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2340  phage integrase family protein  34.85 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2725  integrase family protein  42.96 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.55 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0019  putative integrase/resolvase  30.05 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  29.19 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  27.6 
 
 		 302 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0031  resolvase  26.11 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000452405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  27.73 
 
 		 311 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  26.04 
 
 		 353 aa  53.1  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  26.04 
 
 		 354 aa  53.1  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  24.32 
 
 		 353 aa  52.4  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  27.86 
 
 		 309 aa  52  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 318 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 318 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  26.11 
 
 		 306 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.22 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  28.57 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  23.56 
 
 		 355 aa  50.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  28.57 
 
 		 395 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  31.02 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 317 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  35.44 
 
 		 286 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.6 
 
 		 311 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  37.5 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1258  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  26.38 
 
 		 311 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0007  resolvase  25.22 
 
 		 299 aa  49.3  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  29.17 
 
 		 400 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  44.44 
 
 		 253 aa  48.5  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  25.29 
 
 		 324 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 313 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  26.26 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  27.31 
 
 		 311 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  27.89 
 
 		 317 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  29.47 
 
 		 309 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  37.18 
 
 		 311 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.07 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  27.16 
 
 		 301 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  26.2 
 
 		 313 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0993  phage integrase family protein  28.05 
 
 		 400 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  24.87 
 
 		 310 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  27.32 
 
 		 337 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  26.15 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1628  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  27.32 
 
 		 337 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  30.36 
 
 		 342 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  26.21 
 
 		 304 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  27.32 
 
 		 337 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  27.32 
 
 		 337 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.04 
 
 		 365 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  29.37 
 
 		 386 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0740  putative integrase  35.14 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.650968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  22.87 
 
 		 304 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  26.63 
 
 		 399 aa  45.4  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  23.37 
 
 		 315 aa  45.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.87 
 
 		 299 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 314 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.14 
 
 		 298 aa  45.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  26.6 
 
 		 298 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  33.93 
 
 		 310 aa  45.1  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 336 aa  45.1  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  41.18 
 
 		 159 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  45.4  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  27.4 
 
 		 325 aa  45.1  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  24.19 
 
 		 354 aa  45.1  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  22.16 
 
 		 320 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  25 
 
 		 308 aa  45.1  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.67 
 
 		 298 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  24.19 
 
 		 354 aa  45.1  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1183  phage integrase family protein  24.46 
 
 		 182 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  26.44 
 
 		 312 aa  45.1  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 300 aa  45.1  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  24.19 
 
 		 354 aa  45.1  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.65 
 
 		 308 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1146  tyrosine recombinase XerD  38.57 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.6 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>