More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1580 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  100 
 
 		 378 aa  769    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  54.67 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2790  TOBE domain-containing protein  51.49 
 
 		 438 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  45.13 
 
 		 362 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3411  TOBE domain protein  37.43 
 
 		 359 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  39.75 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2199  TOBE domain-containing protein  38.89 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3517  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.73 
 
 		 380 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1780  TOBE domain protein  28.78 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2367  phage integrase family protein  43.39 
 
 		 211 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.683007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  43.57 
 
 		 142 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  42.45 
 
 		 142 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 268 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  42.45 
 
 		 142 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  41.13 
 
 		 143 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  40.69 
 
 		 272 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  41.3 
 
 		 142 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  37.33 
 
 		 155 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  43.88 
 
 		 142 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  40.24 
 
 		 269 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  42.45 
 
 		 142 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  40.71 
 
 		 142 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  38.57 
 
 		 142 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  39.72 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  41.13 
 
 		 142 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  43.57 
 
 		 142 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2529  integrase family protein  35.05 
 
 		 218 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  41.84 
 
 		 141 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  41.84 
 
 		 141 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  41.84 
 
 		 141 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  41.13 
 
 		 141 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 278 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  40.43 
 
 		 141 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  41.13 
 
 		 141 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 141 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  40.43 
 
 		 141 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 278 aa  99.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 278 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  41.67 
 
 		 177 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 281 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 276 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 281 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  41.84 
 
 		 140 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  43.06 
 
 		 278 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 262 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  37.14 
 
 		 262 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  37.14 
 
 		 265 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  37.14 
 
 		 265 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 		 143 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  35.14 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 269 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0871  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 141 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180666  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  40.85 
 
 		 282 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  39.01 
 
 		 141 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  38.3 
 
 		 263 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 263 aa  93.6  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  36.97 
 
 		 262 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  38.16 
 
 		 282 aa  92.8  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  38.16 
 
 		 282 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  34.75 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  38.16 
 
 		 282 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  38.41 
 
 		 268 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  40.43 
 
 		 142 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  39.72 
 
 		 141 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  38.16 
 
 		 282 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 269 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  38.16 
 
 		 282 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  38.3 
 
 		 263 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  39.04 
 
 		 270 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  38.16 
 
 		 282 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 261 aa  90.9  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 290 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  36.67 
 
 		 270 aa  90.5  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 263 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  35.57 
 
 		 260 aa  89  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  38.51 
 
 		 270 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  36.17 
 
 		 281 aa  86.7  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  38.13 
 
 		 270 aa  86.3  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 278 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  32.78 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  33.97 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 261 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  33.33 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  34.75 
 
 		 142 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 139 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  34.75 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  32.14 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1548  molybdenum-pterin binding protein  32.61 
 
 		 137 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.98183  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  35.46 
 
 		 141 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  30.61 
 
 		 270 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  36.36 
 
 		 139 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>