295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1190 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  100 
 
 
138 aa  266  8.999999999999999e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  49.64 
 
 
139 aa  124  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  49.63 
 
 
268 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  44.29 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  43.97 
 
 
262 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  43.97 
 
 
282 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  43.97 
 
 
282 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  43.97 
 
 
282 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  43.97 
 
 
282 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  43.97 
 
 
282 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  43.57 
 
 
290 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  43.97 
 
 
282 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  46.1 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  43.97 
 
 
282 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  45.39 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  41.01 
 
 
270 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  42.03 
 
 
142 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  42.86 
 
 
142 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  42.45 
 
 
142 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  43.66 
 
 
278 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  43.26 
 
 
143 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  44.29 
 
 
268 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  40.71 
 
 
142 aa  100  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  43.57 
 
 
141 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  42.86 
 
 
269 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  39.13 
 
 
272 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  42.66 
 
 
279 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  41.43 
 
 
141 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  42.86 
 
 
141 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  42.25 
 
 
281 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  41.43 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  42.25 
 
 
278 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  42.25 
 
 
281 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  41.96 
 
 
279 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  40.29 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  39.57 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  37.86 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  37.86 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  40.29 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  39.31 
 
 
270 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  39.57 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  39.31 
 
 
270 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  37.14 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  41.3 
 
 
267 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.14 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  37.14 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  35 
 
 
265 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  43.97 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  35 
 
 
265 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  37.86 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  40.71 
 
 
278 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  40.58 
 
 
269 aa  93.6  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  45 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  38.89 
 
 
269 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  35.71 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  41.43 
 
 
278 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  38.57 
 
 
142 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  40 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  40.58 
 
 
270 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  37.06 
 
 
263 aa  90.9  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  38.73 
 
 
276 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  39.13 
 
 
281 aa  90.9  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  35.46 
 
 
276 aa  90.9  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  36.17 
 
 
274 aa  90.1  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  33.57 
 
 
262 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  37.86 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 
270 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  41.84 
 
 
263 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  38.03 
 
 
278 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  33.57 
 
 
262 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  41.13 
 
 
263 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  38.57 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  36.5 
 
 
260 aa  86.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.69 
 
 
260 aa  85.5  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  36.43 
 
 
177 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  34.04 
 
 
261 aa  84.7  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  37.86 
 
 
269 aa  84  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1436  TOBE domain-containing protein  36.3 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3905  TOBE domain-containing protein  39.13 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  42.14 
 
 
269 aa  80.1  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  35.56 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  33.81 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  40.71 
 
 
269 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  33.57 
 
 
452 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  33.81 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  31.43 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  42.86 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4493  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  39.86 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  33.57 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.81 
 
 
263 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2199  TOBE domain-containing protein  35.82 
 
 
356 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  32.14 
 
 
263 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  37.96 
 
 
270 aa  73.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  28.99 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  55.88 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  57.35 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  32.86 
 
 
263 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>