229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1539 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  100 
 
 		 67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  58.82 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  56.06 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  58.21 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  58.21 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  60 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  60.61 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  55.88 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  57.35 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  53.03 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  50 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1337  TOBE domain-containing protein  50.75 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  48.48 
 
 		 69 aa  67  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  52.24 
 
 		 69 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0609  TOBE domain protein  51.47 
 
 		 68 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00563993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  50 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  50.75 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  53.85 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  51.52 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  50 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  50 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  52.94 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  55.38 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5517  TOBE domain protein  47.76 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520442  normal  0.766178 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  51.47 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  47.76 
 
 		 69 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  48.48 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  53.03 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1743  TOBE domain-containing protein  47.76 
 
 		 69 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  51.52 
 
 		 66 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  53.73 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0612  TOBE domain protein  50 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4493  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  50 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 278 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  43.28 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3573  TOBE domain-containing protein  52.24 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114567  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  47.69 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  49.23 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  50 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  50 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  47.76 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  50 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  50 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  50 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  50 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  50 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  50.75 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3442  TOBE domain protein  49.25 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.650149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  40.3 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  46.27 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 290 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  43.28 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  46.97 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  52.54 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  45.45 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  47.06 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  43.94 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  43.28 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  46.88 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  44.78 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  50 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  41.79 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3905  TOBE domain-containing protein  43.75 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  44.78 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  44.78 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  45.31 
 
 		 263 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  43.94 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  44.78 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  43.94 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  45.45 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  41.79 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1546  TOBE domain-containing protein  42.42 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121614  hitchhiker  0.000827182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1973  molybdenum-pterin binding protein  46.15 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  44.12 
 
 		 270 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  44.62 
 
 		 260 aa  53.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  45.45 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1586  TOBE domain protein  41.79 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0327768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  43.28 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3108  TOBE domain-containing protein  43.94 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0224442  hitchhiker  0.00000231206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  46.97 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  46.27 
 
 		 278 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1436  TOBE domain-containing protein  43.75 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1548  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.98183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  43.28 
 
 		 378 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  43.94 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1119  ABC transporter solute-binding protein  40.3 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 270 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  43.94 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2490  molybdenum-pterin binding  41.79 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.17041  normal  0.0308789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>