223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0416 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  100 
 
 		 69 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  62.32 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  62.32 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  62.32 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  62.32 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  61.76 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  59.42 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  57.97 
 
 		 69 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1743  TOBE domain-containing protein  59.42 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  62.32 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  57.97 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  56.52 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  59.42 
 
 		 69 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5517  TOBE domain protein  57.97 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520442  normal  0.766178 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  55.07 
 
 		 69 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  52.94 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3573  TOBE domain-containing protein  59.42 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114567  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  55.07 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  51.52 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  56.06 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  49.25 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  50 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  49.28 
 
 		 269 aa  67  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  47.76 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  45.59 
 
 		 177 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1337  TOBE domain-containing protein  50 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  51.52 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  51.52 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  49.28 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  49.25 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0612  TOBE domain protein  53.12 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  49.28 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  49.28 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  49.28 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  49.28 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  49.28 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  49.28 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  49.28 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  49.28 
 
 		 282 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  44.78 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 279 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  44.12 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  60 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  47.76 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 276 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  46.27 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 274 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2656  molybdenum-pterin binding  47.83 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00543737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.38 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  48.53 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0274  TOBE domain protein  46.38 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0234749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  47.83 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3942  molybdenum-pterin binding protein  47.83 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  42.65 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3636  TOBE domain-containing protein  44.93 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2490  molybdenum-pterin binding  47.83 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.17041  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2558  molybdenum-pterin binding protein  47.83 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127714  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  49.28 
 
 		 70 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  46.97 
 
 		 281 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  49.28 
 
 		 70 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  49.28 
 
 		 70 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  43.48 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  47.06 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  46.38 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  43.48 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3108  TOBE domain-containing protein  43.48 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0224442  hitchhiker  0.00000231206 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  49.28 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  43.48 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  47.83 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3905  TOBE domain-containing protein  44.78 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  44.93 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1546  TOBE domain-containing protein  44.93 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121614  hitchhiker  0.000827182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  47.06 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4493  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.27 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  43.28 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  46.27 
 
 		 272 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  45.59 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  42.65 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  46.38 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  46.38 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  46.97 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0662  TOBE domain-containing protein  49.28 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.384686  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  43.94 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  44.12 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  44.12 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0609  TOBE domain protein  42.42 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00563993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  45.45 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.38 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  38.24 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  41.18 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>