212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0168 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  100 
 
 
67 aa  127  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  69.7 
 
 
67 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  69.7 
 
 
67 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  64.18 
 
 
69 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  66.18 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  67.65 
 
 
69 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  64.71 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  63.24 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  63.24 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  63.24 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0612  TOBE domain protein  62.5 
 
 
74 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  56.06 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1743  TOBE domain-containing protein  64.71 
 
 
69 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1337  TOBE domain-containing protein  61.54 
 
 
74 aa  77.4  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  63.24 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  56.72 
 
 
68 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5517  TOBE domain protein  63.24 
 
 
69 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520442  normal  0.766178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  52.94 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  50.75 
 
 
68 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  57.35 
 
 
69 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  54.41 
 
 
69 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  52.94 
 
 
69 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  52.94 
 
 
69 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  50.75 
 
 
68 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  52.94 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0609  TOBE domain protein  52.24 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00563993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3573  TOBE domain-containing protein  58.82 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114567  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  56.25 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  47.06 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  55.88 
 
 
263 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  54.41 
 
 
263 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1548  molybdenum-pterin binding protein  47.69 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.98183  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  53.03 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  44.62 
 
 
72 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  48.48 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2490  molybdenum-pterin binding  51.47 
 
 
70 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.17041  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2558  molybdenum-pterin binding protein  51.47 
 
 
70 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127714  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  48.48 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  50.75 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  51.52 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  51.52 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
269 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  44.12 
 
 
290 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  51.47 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  43.08 
 
 
195 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  46.27 
 
 
268 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  50 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  43.28 
 
 
268 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2656  molybdenum-pterin binding  48.53 
 
 
70 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00543737  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 
68 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  46.27 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  50 
 
 
70 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  50 
 
 
70 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  50 
 
 
70 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  47.76 
 
 
268 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  45.59 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1586  TOBE domain protein  49.25 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0327768  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  48.53 
 
 
263 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  46.27 
 
 
269 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  45.59 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  45.59 
 
 
278 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  46.27 
 
 
269 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  44.12 
 
 
279 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  40.91 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  44.78 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 
68 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  48.53 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  44.12 
 
 
279 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  44.78 
 
 
270 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  49.25 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1236  molybdenum-pterin binding protein, putative  40.98 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1993  molybdenum-pterin binding protein  40.98 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  46.97 
 
 
270 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  43.28 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1722  putative molybdenum-pterin binding protein  40.98 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0379  putative molybdenum-pterin binding protein  40.98 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0391614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1824  molybdenum-pterin binding protein  40.98 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1839  molybdenum-pterin binding protein  40.98 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0782  putative molybdenum-pterin binding protein  40.98 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  48.53 
 
 
69 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2490  molybdenum-pterin binding protein  40.98 
 
 
71 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  46.27 
 
 
142 aa  53.9  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  42.65 
 
 
274 aa  53.9  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2498  molybdenum-pterin binding protein, putative  39.34 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
281 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
281 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  46.27 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
278 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1646  TOBE domain-containing protein  37.5 
 
 
71 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285785  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  50.75 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  45.31 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  50.75 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
278 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1546  TOBE domain-containing protein  48.53 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121614  hitchhiker  0.000827182 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
261 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  47.06 
 
 
69 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0278  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 
69 aa  52.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  39.34 
 
 
71 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1119  ABC transporter solute-binding protein  39.68 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1466  molybdenum-pterin binding  39.34 
 
 
71 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0340252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>