213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5868 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  100 
 
 
68 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  77.94 
 
 
68 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  71.21 
 
 
69 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  71.21 
 
 
69 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  71.21 
 
 
69 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  64.18 
 
 
69 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  65.15 
 
 
69 aa  87  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1743  TOBE domain-containing protein  62.12 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  58.82 
 
 
67 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  58.82 
 
 
67 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  56.06 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  59.7 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1337  TOBE domain-containing protein  59.7 
 
 
74 aa  78.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  58.82 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  59.09 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  63.64 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3573  TOBE domain-containing protein  64.18 
 
 
69 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114567  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  56.06 
 
 
69 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5517  TOBE domain protein  57.58 
 
 
69 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520442  normal  0.766178 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  56.06 
 
 
69 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0609  TOBE domain protein  54.41 
 
 
68 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00563993 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0612  TOBE domain protein  57.58 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  56.72 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  51.52 
 
 
69 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  52.24 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  50.75 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  52.24 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  52.24 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  52.24 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  56.06 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  53.73 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  53.73 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0274  TOBE domain protein  56.06 
 
 
69 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0234749 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2558  molybdenum-pterin binding protein  49.25 
 
 
70 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127714  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  48.48 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2490  molybdenum-pterin binding  49.25 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.17041  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3108  TOBE domain-containing protein  50 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0224442  hitchhiker  0.00000231206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  50.75 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  48.48 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3636  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1546  TOBE domain-containing protein  50 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121614  hitchhiker  0.000827182 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  50.77 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  49.23 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  47.06 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  48.53 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2656  molybdenum-pterin binding  46.27 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00543737  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  49.25 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  45.59 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  47.76 
 
 
141 aa  60.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  49.25 
 
 
263 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  45.45 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  45.45 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  45.45 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  43.94 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  50 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  43.94 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  50.75 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  45.45 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  44.78 
 
 
269 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  43.94 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  43.94 
 
 
72 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  49.25 
 
 
68 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  44.78 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0114044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0662  TOBE domain-containing protein  56.06 
 
 
69 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.384686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  48.48 
 
 
69 aa  57  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  50 
 
 
68 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  50 
 
 
68 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  42.42 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  46.97 
 
 
260 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  47.76 
 
 
278 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  42.42 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  44.78 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  40.91 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1559  molybdenum-pterin binding protein  46.27 
 
 
69 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0856932  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  42.65 
 
 
281 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  42.42 
 
 
269 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  50 
 
 
263 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  43.94 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  40.91 
 
 
263 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  45.45 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  46.27 
 
 
268 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  45.45 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  48.53 
 
 
263 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  45.45 
 
 
270 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  41.18 
 
 
272 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4493  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  45.31 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  44.12 
 
 
195 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  49.25 
 
 
268 aa  53.9  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1530  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  43.28 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438409 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  42.42 
 
 
69 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  41.79 
 
 
269 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  46.97 
 
 
265 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  46.97 
 
 
265 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  42.42 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  43.28 
 
 
269 aa  52.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  40.91 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  43.94 
 
 
140 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
261 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>