222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2403 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  100 
 
 		 69 aa  130  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  59.42 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  59.42 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1546  TOBE domain-containing protein  55.07 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121614  hitchhiker  0.000827182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0274  TOBE domain protein  57.97 
 
 		 69 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0234749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  55.07 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  57.58 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3108  TOBE domain-containing protein  53.62 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0224442  hitchhiker  0.00000231206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3636  TOBE domain-containing protein  52.17 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  53.62 
 
 		 70 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1559  molybdenum-pterin binding protein  56.52 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0856932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  53.62 
 
 		 70 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  53.62 
 
 		 70 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  53.62 
 
 		 70 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  51.52 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0114044 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  55.07 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2490  molybdenum-pterin binding  50.72 
 
 		 70 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.17041  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2558  molybdenum-pterin binding protein  50.72 
 
 		 70 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127714  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2656  molybdenum-pterin binding  47.83 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00543737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1586  TOBE domain protein  56.52 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0327768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3942  molybdenum-pterin binding protein  46.38 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  49.28 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  53.85 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  48.48 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  52.31 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  52.31 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  52.31 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  50.77 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  49.28 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  49.23 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  45.45 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  43.94 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  52.31 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1530  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00438409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  49.28 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.97 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  46.38 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  45.71 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  46.38 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  46.38 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  44.29 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 261 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  40.58 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  44.93 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 269 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  45.59 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  43.48 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  46.38 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.58 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  39.13 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  43.48 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0662  TOBE domain-containing protein  52.17 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.384686  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  39.39 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  43.48 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  42.42 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  42.42 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  42.03 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  44.12 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  40.58 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  41.18 
 
 		 260 aa  57.4  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 268 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  40 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  46.97 
 
 		 267 aa  57  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 263 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  44.93 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  51.56 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 269 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0340  TOBE domain protein  43.48 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856437 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  41.54 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  41.18 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  42.65 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  43.48 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  40.91 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2971  TOBE domain protein  51.56 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  42.03 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  39.71 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3442  TOBE domain protein  48.48 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.650149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  34.78 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  43.48 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  39.13 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  44.93 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 274 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  45.31 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0209  TOBE domain protein  50.72 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.723905  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  44.93 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  42.19 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  42.03 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 279 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  45.45 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  42.86 
 
 		 282 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  46.15 
 
 		 269 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  51.52 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>