199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0209 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0209  TOBE domain protein  100 
 
 
78 aa  152  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.723905  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1586  TOBE domain protein  84.06 
 
 
69 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0327768  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  51.52 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  44.74 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.38 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  49.25 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  42.03 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  50 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  49.28 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  50 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  44.93 
 
 
278 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  46.48 
 
 
263 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  43.66 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  47.76 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  43.04 
 
 
269 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  43.66 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  45.71 
 
 
261 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  44.93 
 
 
278 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  45.07 
 
 
263 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  47.14 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0114044 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  38.46 
 
 
257 aa  60.5  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  42.03 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0274  TOBE domain protein  46.38 
 
 
69 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0234749 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  44.12 
 
 
270 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  44.93 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2490  molybdenum-pterin binding  46.38 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.17041  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2656  molybdenum-pterin binding  44.93 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00543737  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  44.93 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  44.93 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  44.93 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  43.06 
 
 
270 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  45.59 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1546  TOBE domain-containing protein  43.48 
 
 
69 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121614  hitchhiker  0.000827182 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  45.45 
 
 
267 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  44.93 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  44.93 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  41.18 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  44.44 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  44.44 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  42.65 
 
 
268 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2558  molybdenum-pterin binding protein  44.93 
 
 
70 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127714  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  44.93 
 
 
69 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0662  TOBE domain-containing protein  49.28 
 
 
69 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.384686  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1559  molybdenum-pterin binding protein  47.83 
 
 
69 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0856932  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  43.06 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  43.28 
 
 
274 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  44.44 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  43.28 
 
 
269 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  41.67 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  44.44 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  40.3 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  40.58 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  43.28 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  40 
 
 
268 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  40.58 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  42.65 
 
 
269 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  42.03 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3636  TOBE domain-containing protein  43.48 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  43.28 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  50.72 
 
 
69 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  40.58 
 
 
69 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3108  TOBE domain-containing protein  43.48 
 
 
69 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0224442  hitchhiker  0.00000231206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  48.53 
 
 
177 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  43.28 
 
 
269 aa  53.9  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  43.33 
 
 
59 aa  53.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  38.81 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  38.81 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  41.79 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  44.12 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  37.14 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  40.58 
 
 
69 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0278  TOBE domain-containing protein  41.18 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  37.68 
 
 
69 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  44.93 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.68 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  44.93 
 
 
269 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  41.79 
 
 
272 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3942  molybdenum-pterin binding protein  39.13 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  37.68 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  39.39 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  35.14 
 
 
260 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  42.03 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  41.18 
 
 
263 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0340  TOBE domain protein  39.39 
 
 
69 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856437 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  40.58 
 
 
278 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  40.58 
 
 
281 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  40.58 
 
 
281 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1743  TOBE domain-containing protein  37.68 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
263 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  40.3 
 
 
270 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  44.12 
 
 
67 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  39.13 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  39.44 
 
 
270 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  43.48 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  42.65 
 
 
378 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
276 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3442  TOBE domain protein  42.42 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.650149  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  36.23 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  36.23 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.142109 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>