257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3207 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 72 aa  141  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  50.72 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  55.07 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  51.61 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  48.48 
 
 		 68 aa  67  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  50.85 
 
 		 59 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  52.31 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  49.28 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  49.25 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  52.17 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  51.61 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  54.84 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  49.25 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  48.44 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  44.62 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  44.93 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  46.97 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  45.21 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  47.83 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  40.58 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  43.48 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  47.76 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  43.48 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  43.48 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  47.62 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1337  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  50.79 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  46.38 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  51.61 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  46.27 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  47.83 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  47.69 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  44.93 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  47.76 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1586  TOBE domain protein  39.13 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0327768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  46.38 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 276 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  36.92 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.58 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  46.38 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  46.38 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  46.38 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3442  TOBE domain protein  45.45 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.650149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  47.83 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 262 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  43.94 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  45.16 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  43.08 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  49.23 
 
 		 262 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  43.08 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  41.1 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 274 aa  57.4  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 268 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 266 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  43.48 
 
 		 69 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  42.03 
 
 		 69 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  45.71 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  45.16 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 278 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  44.62 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  45.31 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  42.42 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  43.75 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0612  TOBE domain protein  45.45 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  43.94 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  43.48 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  46.38 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  43.75 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  43.08 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  43.48 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1743  TOBE domain-containing protein  43.48 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  49.23 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3636  TOBE domain-containing protein  37.68 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  41.67 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1546  TOBE domain-containing protein  37.68 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121614  hitchhiker  0.000827182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  42.42 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  48.39 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  40 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  40 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  42.19 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0274  TOBE domain protein  42.03 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0234749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  40 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  39.68 
 
 		 260 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  43.94 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0340  TOBE domain protein  37.68 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856437 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  43.75 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>