158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1230 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  100 
 
 
133 aa  261  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  64.12 
 
 
136 aa  164  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  64.12 
 
 
136 aa  160  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  65.91 
 
 
135 aa  160  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  65.65 
 
 
135 aa  156  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  61.83 
 
 
134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  60.31 
 
 
134 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  60.31 
 
 
134 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  65.38 
 
 
134 aa  146  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  61.72 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  58.21 
 
 
135 aa  143  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  59.54 
 
 
136 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  64.62 
 
 
140 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  60.47 
 
 
131 aa  141  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  57.89 
 
 
133 aa  139  9e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  58.65 
 
 
135 aa  139  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  61.24 
 
 
130 aa  137  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  65.87 
 
 
132 aa  137  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  58.91 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  59.23 
 
 
132 aa  136  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  58.21 
 
 
132 aa  134  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  57.04 
 
 
132 aa  131  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  57.14 
 
 
127 aa  130  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  57.58 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  56.06 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  57.58 
 
 
133 aa  123  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  57.03 
 
 
127 aa  123  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  61.79 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  55.15 
 
 
133 aa  116  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  42.31 
 
 
138 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  34.65 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.97 
 
 
72 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  50 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  46.38 
 
 
268 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  48.39 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
276 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  42.03 
 
 
270 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  35 
 
 
177 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  35.56 
 
 
140 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  31.36 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  39.06 
 
 
263 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  46.03 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  46.27 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0871  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.28 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180666  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  42.19 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
268 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  35.42 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  30.65 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  33.67 
 
 
269 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  46.88 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  43.28 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  39.06 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  40.85 
 
 
272 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  41.27 
 
 
281 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
269 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  40.32 
 
 
67 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.13 
 
 
367 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  34.78 
 
 
267 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  40.62 
 
 
278 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  37.66 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  34.38 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  44.44 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  37.1 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  36.26 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  41.1 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  32.81 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  34.38 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  47.62 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  36.26 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19590  putative molybdopterin-binding protein  32.31 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1686  putative molybdopterin-binding protein  32.31 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  34.85 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0241  TOBE domain protein  33.85 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252493  normal  0.0167291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  33.87 
 
 
195 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  27.94 
 
 
257 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
263 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  38.46 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  36.92 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  40 
 
 
268 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0256  TOBE domain-containing protein  33.85 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0359931  normal  0.02055 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  42.19 
 
 
452 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  34.95 
 
 
262 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  43.66 
 
 
282 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
263 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  43.66 
 
 
282 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  43.66 
 
 
282 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  43.66 
 
 
282 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  43.66 
 
 
282 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  43.66 
 
 
282 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  36.26 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  42.86 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  35.94 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  38.54 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4319  TOBE domain-containing protein  32.31 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  42.86 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  41.43 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5313  molybdenum-pterin binding domain protein  30.77 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  44.44 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  42.19 
 
 
374 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  38.27 
 
 
276 aa  43.5  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>