89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1951 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 132 aa  259  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  62.41 
 
 		 135 aa  157  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  64.89 
 
 		 136 aa  156  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  63.08 
 
 		 132 aa  154  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  56.82 
 
 		 136 aa  153  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  63.57 
 
 		 133 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  62.2 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  56.06 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  61.54 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  63.57 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  62.31 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  60.31 
 
 		 134 aa  143  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  59.54 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  59.54 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  60.15 
 
 		 135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  57.81 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  60.34 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  60.15 
 
 		 135 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  62.4 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  58.21 
 
 		 133 aa  134  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  55.64 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  50.39 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  57.36 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  55.3 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  58.59 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  57.03 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  55.91 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  59.35 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  54.96 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  44.8 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  34.65 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.27 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 266 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  40.62 
 
 		 452 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  38.67 
 
 		 374 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  42.65 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  34.85 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  40 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0114044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0054  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 		 361 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 		 267 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  43.08 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  32.88 
 
 		 282 aa  43.5  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  32.88 
 
 		 262 aa  43.5  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  32.88 
 
 		 282 aa  43.5  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  32.88 
 
 		 282 aa  43.5  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  32.88 
 
 		 282 aa  43.5  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  32.88 
 
 		 282 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  33.33 
 
 		 360 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  34.25 
 
 		 263 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  40 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  32.88 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  31 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  31 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5410  molybdenum-pterin binding protein  35 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  hitchhiker  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 268 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  38.71 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  35.82 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  37.5 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 		 353 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  33.87 
 
 		 195 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0265  TOBE domain-containing protein  33.33 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4971  TOBE domain-containing protein  33.33 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0185371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  38.33 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 281 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 281 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 263 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  31.82 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  37.88 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0241  TOBE domain protein  33.33 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252493  normal  0.0167291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0256  TOBE domain-containing protein  33.33 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0359931  normal  0.02055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  39.34 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  36.17 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  34.85 
 
 		 278 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  34.85 
 
 		 378 aa  40.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1686  putative molybdopterin-binding protein  31.67 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  35 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19590  putative molybdopterin-binding protein  31.67 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  37.88 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  38.81 
 
 		 272 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4873  molybdenum-pterin binding protein  33.33 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5313  molybdenum-pterin binding domain protein  33.33 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  35.94 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  31.67 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0274  TOBE domain protein  36.92 
 
 		 69 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0234749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>