84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1070 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  257  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  63.85 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  59.69 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  62.31 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  63.85 
 
 		 133 aa  144  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  62.31 
 
 		 136 aa  143  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  63.36 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  61.24 
 
 		 133 aa  137  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  57.69 
 
 		 135 aa  135  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  60.16 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  59.23 
 
 		 132 aa  133  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  56.92 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  58.91 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  56.25 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  56.25 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  56.25 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  58.27 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  55.47 
 
 		 136 aa  127  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  55.47 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  52.8 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  54.14 
 
 		 135 aa  123  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  57.63 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  61.11 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  60.31 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  53.91 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  53.12 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  42.4 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  34.65 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  47.62 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  45.61 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  41.79 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  33.33 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  37.5 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  37.5 
 
 		 281 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  38.81 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  40.62 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 279 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  43.48 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 279 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  36.76 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  38.24 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  37.5 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  27.18 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  40.62 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  40.62 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1572  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.32 
 
 		 363 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00359628 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  41.27 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  41.27 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  39.68 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  32.31 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  41.27 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  41.27 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  33.7 
 
 		 262 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 262 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  41.27 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  41.27 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  34.92 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  41.27 
 
 		 262 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0209  TOBE domain protein  36.36 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.723905  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 278 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  35.82 
 
 		 270 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  39.06 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3727  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 367 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  36.36 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 		 268 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  36.92 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3531  DNA binding domain-containing protein  38 
 
 		 308 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  33.66 
 
 		 374 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  39.06 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  41.82 
 
 		 269 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  32.35 
 
 		 378 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  36.51 
 
 		 263 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0892  ABC transporter related  32.47 
 
 		 364 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.319827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.51 
 
 		 372 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  42.19 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  33.33 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 278 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0373  TOBE domain protein  29.69 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2109  ABC-type molybdate transport system, ATPase component  33.9 
 
 		 351 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3942  molybdenum-pterin binding protein  40.62 
 
 		 69 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0213707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>