88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34150 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  100 
 
 		 140 aa  277  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  68.42 
 
 		 134 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  67.67 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  67.67 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  67.69 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  68.7 
 
 		 135 aa  170  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  63.08 
 
 		 133 aa  159  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  61.76 
 
 		 145 aa  156  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  64.62 
 
 		 133 aa  156  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  63.85 
 
 		 136 aa  155  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  60.31 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  62.6 
 
 		 134 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  64.17 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  66.67 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  60 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  57.14 
 
 		 135 aa  141  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  62.79 
 
 		 133 aa  140  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  63.78 
 
 		 132 aa  139  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  56.52 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  57.25 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  57.69 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  58.91 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  60.31 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  58.33 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  58.59 
 
 		 131 aa  127  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  59.52 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  56.62 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  55.4 
 
 		 141 aa  120  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  54.76 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  43.9 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  33.85 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  45.92 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  50 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  45.95 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 270 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  47.62 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  32.29 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  38.89 
 
 		 362 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  30.95 
 
 		 452 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  47.62 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  42.19 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  37.66 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  39.06 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  39.73 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 268 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 290 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  40.96 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  39.06 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  37.5 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  42.86 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 279 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  25.58 
 
 		 260 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  38.57 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  40.85 
 
 		 268 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  37.14 
 
 		 263 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  41.94 
 
 		 69 aa  42  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  38.71 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  38.71 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  41.07 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  31.4 
 
 		 140 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  25.66 
 
 		 195 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  35.71 
 
 		 263 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 267 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  35.48 
 
 		 67 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  40 
 
 		 142 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  40.32 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  36 
 
 		 278 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 281 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 281 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  38.1 
 
 		 281 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 263 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  38.78 
 
 		 271 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2790  TOBE domain-containing protein  30.66 
 
 		 438 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3961  DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 314 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  34.33 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  37.84 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  37.84 
 
 		 262 aa  40  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  37.84 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  37.84 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  37.84 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  37.84 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  37.84 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 278 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  30.93 
 
 		 269 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  36.51 
 
 		 69 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>