132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2544 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  271  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  95.68 
 
 		 141 aa  240  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  74.44 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  71.65 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  70.87 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  70.87 
 
 		 127 aa  157  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  66.14 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  60 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  60.94 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  56.72 
 
 		 134 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  55.97 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  55.97 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  63.78 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  60.47 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  56.25 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  58.14 
 
 		 133 aa  134  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  56.06 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  57.36 
 
 		 135 aa  131  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  57.58 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  54.33 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  57.69 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  50 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  55.47 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  54.55 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  56.03 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  58.82 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  52.17 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  51.91 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  45.67 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  35.48 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  50.79 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  39.06 
 
 		 195 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2490  molybdenum-pterin binding protein  43.28 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  40.3 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1085  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.3 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252098  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1565  molybdenum-pterin binding  40.3 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.239605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1541  TOBE domain-containing protein  40.3 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00697531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  46.97 
 
 		 69 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1839  molybdenum-pterin binding protein  41.79 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1466  molybdenum-pterin binding  40.3 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0340252  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  43.75 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  43.75 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1667  TOBE domain-containing protein  40.3 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000784196  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1487  TOBE domain-containing protein  40.3 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1236  molybdenum-pterin binding protein, putative  41.79 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1993  molybdenum-pterin binding protein  41.79 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2498  molybdenum-pterin binding protein, putative  40.3 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1722  putative molybdenum-pterin binding protein  41.79 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0379  putative molybdenum-pterin binding protein  41.79 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0391614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1824  molybdenum-pterin binding protein  41.79 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0782  putative molybdenum-pterin binding protein  41.79 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  42.86 
 
 		 69 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  44.44 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3574  response regulator receiver domain-containing protein  44.12 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  44.44 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1646  TOBE domain-containing protein  38.81 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285785  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1747  TOBE domain protein  38.81 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  44.44 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2971  TOBE domain protein  40.32 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 269 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  44.44 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3640  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 207 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  41.54 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3714  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 207 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  47.83 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3695  DNA binding domain-containing protein  54 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0265  TOBE domain-containing protein  35.48 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4971  TOBE domain-containing protein  35.48 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0185371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  44.44 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  44.44 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5517  TOBE domain protein  44.44 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520442  normal  0.766178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5313  molybdenum-pterin binding domain protein  35.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4873  molybdenum-pterin binding protein  35.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0241  TOBE domain protein  35.48 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252493  normal  0.0167291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  53.66 
 
 		 201 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19590  putative molybdopterin-binding protein  33.87 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0256  TOBE domain-containing protein  35.48 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0359931  normal  0.02055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1686  putative molybdopterin-binding protein  33.87 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5410  molybdenum-pterin binding protein  35.48 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  hitchhiker  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1774  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448602  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  32.53 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 270 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  44.44 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  30.93 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  33.33 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  47.83 
 
 		 295 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2415  TOBE domain-containing protein  36.51 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4319  TOBE domain-containing protein  34.92 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  32.31 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  36.9 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1218  TOBE domain protein  33.87 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.187717 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  58.82 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  41.27 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0114044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>