69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0373 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0373  TOBE domain protein  100 
 
 
133 aa  263  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1996  TOBE domain protein  62.12 
 
 
143 aa  159  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0439  TOBE domain-containing protein  65.12 
 
 
131 aa  154  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1711  hypothetical protein  51.49 
 
 
142 aa  138  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0452  TOBE domain protein  37.8 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424137  normal  0.700123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0415  TOBE domain protein  39.37 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.333016  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1718  TOBE domain protein  31.2 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.57263  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  32.61 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0316  hypothetical protein  25.98 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.648442  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2205  beta-lactamase HcpA  29.69 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0924  hypothetical protein  29.23 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0123156  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  27.59 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  39.06 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1218  TOBE domain protein  33.33 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.187717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1281  TOBE domain protein  33.33 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.238328  normal  0.240101 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0583  molybdenum import ATP-binding protein ModC  28.95 
 
 
132 aa  48.1  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  31.75 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  32.22 
 
 
265 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.22 
 
 
265 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  35.38 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  35.38 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  33.71 
 
 
262 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0347  TOBE domain-containing protein  29.77 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.478778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0618  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000430997  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2415  TOBE domain-containing protein  31.75 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0324  TOBE domain-containing protein  36.78 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  32.58 
 
 
262 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0119  molybdenum-pterin binding protein II  32.81 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.148673  hitchhiker  0.000165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  26.92 
 
 
362 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1973  molybdenum-pterin binding protein  30.16 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  26.98 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1487  TOBE domain-containing protein  28.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2498  molybdenum-pterin binding protein, putative  26.98 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1993  molybdenum-pterin binding protein  28.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2490  molybdenum-pterin binding protein  28.57 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  28.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  26.98 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1667  TOBE domain-containing protein  28.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000784196  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1541  TOBE domain-containing protein  28.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00697531  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0782  putative molybdenum-pterin binding protein  28.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1839  molybdenum-pterin binding protein  28.57 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1824  molybdenum-pterin binding protein  28.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0379  putative molybdenum-pterin binding protein  28.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0391614  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1722  putative molybdenum-pterin binding protein  28.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1236  molybdenum-pterin binding protein, putative  28.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1565  molybdenum-pterin binding  28.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.239605  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1085  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  28.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252098  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1466  molybdenum-pterin binding  28.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0340252  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  32.94 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  34.94 
 
 
142 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1646  TOBE domain-containing protein  26.98 
 
 
71 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285785  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  30.49 
 
 
272 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1747  TOBE domain protein  26.98 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0241  TOBE domain protein  30.16 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252493  normal  0.0167291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4971  TOBE domain-containing protein  30.16 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0185371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0265  TOBE domain-containing protein  30.16 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
274 aa  41.2  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  33.85 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0256  TOBE domain-containing protein  30.16 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0359931  normal  0.02055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  33.82 
 
 
276 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1686  putative molybdopterin-binding protein  31.75 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19590  putative molybdopterin-binding protein  31.75 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1774  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  28.57 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  32.31 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5410  molybdenum-pterin binding protein  30.16 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  hitchhiker  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4319  TOBE domain-containing protein  30.16 
 
 
90 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  29.69 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  31.11 
 
 
145 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1819  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  28.74 
 
 
353 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>