58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1996 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1996  TOBE domain protein  100 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0439  TOBE domain-containing protein  70.77 
 
 		 131 aa  175  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0373  TOBE domain protein  62.12 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1711  hypothetical protein  51.56 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0452  TOBE domain protein  39.37 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424137  normal  0.700123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0415  TOBE domain protein  37.8 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.333016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1718  TOBE domain protein  30.4 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.57263  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0316  hypothetical protein  29.37 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.648442  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  41.54 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0583  molybdenum import ATP-binding protein ModC  28.81 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  41.07 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  35.59 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1664  tobe domain-containing protein  36.47 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  34.92 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  37.5 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0347  TOBE domain-containing protein  30.48 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.478778  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  32.79 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  36.92 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  35.94 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0324  TOBE domain-containing protein  31.87 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  32.2 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  34.38 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 274 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1218  TOBE domain protein  33.9 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.187717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1281  TOBE domain protein  33.9 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.238328  normal  0.240101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4319  TOBE domain-containing protein  32.2 
 
 		 90 aa  42  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  29.27 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  27.12 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  32.2 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  32.56 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  38.46 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  32.81 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  29.51 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  36.51 
 
 		 142 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  30.16 
 
 		 135 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  37.18 
 
 		 141 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3442  TOBE domain protein  32.26 
 
 		 67 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.650149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  36.51 
 
 		 142 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 135 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  35.94 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  36 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  39.68 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0114044 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4971  TOBE domain-containing protein  32.2 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0185371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0265  TOBE domain-containing protein  32.2 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0618  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000430997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0256  TOBE domain-containing protein  32.2 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0359931  normal  0.02055 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  33.33 
 
 		 265 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0241  TOBE domain protein  32.2 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252493  normal  0.0167291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5410  molybdenum-pterin binding protein  30.51 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  hitchhiker  0.00653645 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  37.7 
 
 		 269 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3905  TOBE domain-containing protein  34.44 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 69 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>