27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0415 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0415  TOBE domain protein  100 
 
 
150 aa  305  9e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.333016  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0452  TOBE domain protein  51.52 
 
 
133 aa  140  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424137  normal  0.700123 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0373  TOBE domain protein  39.37 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1711  hypothetical protein  39.37 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0439  TOBE domain-containing protein  38.58 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1996  TOBE domain protein  37.8 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1718  TOBE domain protein  33.33 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.57263  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0583  molybdenum import ATP-binding protein ModC  28.44 
 
 
132 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  31.13 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  36.92 
 
 
262 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0316  hypothetical protein  24.8 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.648442  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  28.97 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  32.58 
 
 
270 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  36.15 
 
 
262 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.09 
 
 
265 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  32.09 
 
 
265 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  31.15 
 
 
272 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1586  TOBE domain protein  38.46 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0327768  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  22.99 
 
 
195 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  35.94 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.92 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  29.73 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  33.33 
 
 
68 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  33.33 
 
 
68 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0347  TOBE domain-containing protein  26.23 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.478778  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2205  beta-lactamase HcpA  25.24 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0924  hypothetical protein  22.4 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0123156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>