254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3905 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3905  TOBE domain-containing protein  100 
 
 
140 aa  261  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4493  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  75 
 
 
140 aa  165  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1436  TOBE domain-containing protein  60.43 
 
 
140 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  44.6 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  41.01 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  43.26 
 
 
141 aa  93.6  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  41.91 
 
 
278 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  39.13 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  40.29 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
278 aa  87.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  40.29 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  36.69 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  39.01 
 
 
278 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  40.15 
 
 
276 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  42.34 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  38.3 
 
 
278 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  36.36 
 
 
263 aa  81.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  38.3 
 
 
281 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  41.01 
 
 
265 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  38.3 
 
 
281 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  38.3 
 
 
278 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  41.01 
 
 
265 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  41.04 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  35.04 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  37.41 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  38.03 
 
 
279 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  40.44 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  36.96 
 
 
142 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  38.03 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  37.86 
 
 
282 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  41.01 
 
 
262 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  34.78 
 
 
261 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  34.31 
 
 
260 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  37.14 
 
 
282 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  37.14 
 
 
262 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  36.76 
 
 
268 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  37.14 
 
 
282 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  37.14 
 
 
282 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  37.14 
 
 
282 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  41.01 
 
 
262 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  37.14 
 
 
282 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  37.14 
 
 
282 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  40.44 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  35.25 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  37.23 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  36.69 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  38.46 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  36.76 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  35.71 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  37.5 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  40.15 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  33.57 
 
 
281 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  33.81 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  32.39 
 
 
274 aa  67  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  34.78 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  34.56 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  33.58 
 
 
267 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  36.96 
 
 
263 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  34.59 
 
 
265 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  37.24 
 
 
276 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  36.23 
 
 
263 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  33.08 
 
 
290 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  29.86 
 
 
263 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  33.57 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.76 
 
 
262 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.24 
 
 
263 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  31.91 
 
 
269 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  35.51 
 
 
269 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  34.06 
 
 
270 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  32.37 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  33.81 
 
 
263 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  37.5 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  25.53 
 
 
261 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  30.37 
 
 
272 aa  60.1  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  29.71 
 
 
177 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  48.48 
 
 
71 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  35.97 
 
 
269 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  33.09 
 
 
141 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  45.31 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1586  TOBE domain protein  41.18 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0327768  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  44.78 
 
 
69 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  47.76 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  43.75 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  33.09 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  31.65 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  32.37 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  32.12 
 
 
260 aa  57.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  43.94 
 
 
68 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2490  molybdenum-pterin binding protein  46.97 
 
 
71 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  43.94 
 
 
71 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 
71 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  44.78 
 
 
71 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  33.81 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1085  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  45.45 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252098  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  31.65 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0583  molybdenum import ATP-binding protein ModC  32.98 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  31.65 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1541  TOBE domain-containing protein  45.45 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00697531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>