229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1436 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1436  TOBE domain-containing protein  100 
 
 
140 aa  260  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3905  TOBE domain-containing protein  60.43 
 
 
140 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4493  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  61.59 
 
 
140 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  37.04 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  39.71 
 
 
265 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  39.71 
 
 
265 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  41.18 
 
 
262 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  36.3 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  36.17 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  33.82 
 
 
261 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  36.03 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  37.23 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  33.09 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  35.51 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  31.11 
 
 
260 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  34.56 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  37.23 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  33.82 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  33.33 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  32.12 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  34.31 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  32.35 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  31.62 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  34.56 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  34.07 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  29.41 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  33.82 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  29.2 
 
 
274 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  32.59 
 
 
260 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  33.82 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  29.93 
 
 
261 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  30.37 
 
 
272 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  32.35 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  28.99 
 
 
263 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  31.85 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  30.88 
 
 
263 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  34.31 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  29.63 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  33.82 
 
 
278 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  32.35 
 
 
269 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2847  Fis family transcriptional regulator  40.22 
 
 
362 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.801807  normal  0.896227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  31.62 
 
 
269 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  33.82 
 
 
278 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  32.35 
 
 
268 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  33.58 
 
 
262 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  33.58 
 
 
282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  33.58 
 
 
282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  33.58 
 
 
282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  33.58 
 
 
282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 
365 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
362 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  31.39 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  31.85 
 
 
270 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  33.58 
 
 
282 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  31.62 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
278 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
281 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
281 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  33.08 
 
 
265 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2041  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.56 
 
 
356 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  31.88 
 
 
278 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  31.62 
 
 
177 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  33.58 
 
 
282 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  48.39 
 
 
69 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  34.31 
 
 
282 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  39.39 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  41.94 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  30.15 
 
 
270 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  40.32 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  33.82 
 
 
268 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  32.35 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  41.79 
 
 
69 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  31.58 
 
 
268 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  28.68 
 
 
378 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  29.41 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
276 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0054  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.27 
 
 
361 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  31.39 
 
 
276 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  43.75 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  45.16 
 
 
69 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  40.62 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  30.83 
 
 
290 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  29.93 
 
 
281 aa  52  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  30.94 
 
 
141 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.55 
 
 
367 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  32.61 
 
 
278 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1548  molybdenum-pterin binding protein  30.37 
 
 
137 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.98183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  31.39 
 
 
263 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  43.75 
 
 
68 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2720  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 
357 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3411  TOBE domain protein  29.66 
 
 
359 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  28.89 
 
 
267 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  45.16 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  40.62 
 
 
68 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  40.3 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0871  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  31.58 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180666  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3968  transcriptional regulator, ModE family  32.56 
 
 
234 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  45.31 
 
 
69 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>