265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4493 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4493  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  253  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3905  TOBE domain-containing protein  75 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1436  TOBE domain-containing protein  61.59 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  46.76 
 
 		 265 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  46.76 
 
 		 265 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  42.22 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  39.86 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 262 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  45.32 
 
 		 262 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 278 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  42.34 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  38.69 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 278 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 281 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 281 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  40 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 274 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 278 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  39.29 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  41.01 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  40.58 
 
 		 278 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.3 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  40.29 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  38.85 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  38.57 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  37.59 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  39.13 
 
 		 268 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  40.97 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 263 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  39.85 
 
 		 265 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  36.96 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  39.29 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  39.29 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  39.29 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  39.29 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  39.29 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  39.29 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 279 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  37.68 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  40 
 
 		 282 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  39.29 
 
 		 282 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  34.29 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  37.96 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  37.32 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  36.23 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  36.76 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  50 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  34.07 
 
 		 267 aa  67.8  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  36.23 
 
 		 269 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  32.41 
 
 		 281 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 290 aa  67  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 270 aa  66.6  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  45.45 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  48.48 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  29.79 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 268 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  33.81 
 
 		 263 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  29.5 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  36.43 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  50 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  33.81 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  33.33 
 
 		 270 aa  62  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  33.33 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.77 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 261 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 263 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  36.11 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  30.43 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1548  molybdenum-pterin binding protein  35.04 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.98183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  35.71 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  32.37 
 
 		 378 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 367 aa  60.1  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0452  TOBE domain protein  37.04 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424137  normal  0.700123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  51.39 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.05 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  33.09 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  35.86 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.57 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  46.27 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  35.86 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  33.82 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  44.78 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.04 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>