96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1854 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  100 
 
 		 133 aa  266  8.999999999999999e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  65.12 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  65.89 
 
 		 136 aa  167  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  64.89 
 
 		 134 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  64.34 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  64.34 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  57.48 
 
 		 145 aa  153  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  59.84 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  57.14 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  57.89 
 
 		 133 aa  139  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  61.24 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  59.23 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  61.02 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  58.14 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  59.23 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  58.59 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  51.94 
 
 		 135 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  50.39 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  51.18 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  51.52 
 
 		 132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  51.91 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  54.47 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  52.42 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  52.8 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  49.61 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  52.34 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  54.33 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  53.54 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  55 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  40.8 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  33.6 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  33.33 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  44.44 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  43.55 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  41.27 
 
 		 269 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  41.94 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  27.34 
 
 		 452 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  38.1 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  39.68 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  37.1 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  39.68 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  36.92 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 290 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  37.21 
 
 		 272 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  44.44 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  46.03 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  32.18 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  41.27 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 270 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1996  TOBE domain protein  32.79 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  35.8 
 
 		 362 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 268 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  37.5 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  35.48 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  37.7 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  37.7 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0583  molybdenum import ATP-binding protein ModC  29.35 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  35.48 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  27.68 
 
 		 267 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  44.44 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  40.62 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  37.1 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  37.1 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  39.34 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  38.1 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  36.51 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  36.92 
 
 		 268 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  36.51 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0892  ABC transporter related  34.21 
 
 		 364 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.319827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1337  TOBE domain-containing protein  39.39 
 
 		 74 aa  42  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  35.71 
 
 		 374 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  33.33 
 
 		 378 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  35.38 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  32.84 
 
 		 365 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1281  TOBE domain protein  35.38 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.238328  normal  0.240101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  32.46 
 
 		 367 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  38.1 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1973  molybdenum-pterin binding protein  35.38 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1218  TOBE domain protein  35.38 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.187717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  38.1 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  38.1 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4319  TOBE domain-containing protein  31.03 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  39.68 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 263 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  35.38 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 		 263 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  38.1 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.66 
 
 		 372 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5410  molybdenum-pterin binding protein  35.48 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  hitchhiker  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  34.92 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  37.88 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 		 263 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  35.94 
 
 		 142 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>