108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4972 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 131 aa  256  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  70.08 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  69.84 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  65.89 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  63.85 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  62.2 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  62.79 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  63.36 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  60.47 
 
 		 133 aa  141  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  61.72 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  63.2 
 
 		 133 aa  137  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  56.59 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  57.14 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  63.2 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  62.99 
 
 		 141 aa  133  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  62.2 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  57.48 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  59.06 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  58.27 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  58.27 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  54.47 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  55.73 
 
 		 135 aa  123  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  58.59 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  55.17 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  59.35 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  57.27 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  57.27 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  57.81 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  42.64 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  35.94 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  50 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1572  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 363 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00359628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 266 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  39.19 
 
 		 452 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 278 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1085  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252098  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1565  molybdenum-pterin binding  38.1 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.239605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1541  TOBE domain-containing protein  38.1 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00697531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  38.1 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  38.46 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  31.82 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  31.82 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  41.27 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0114044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  41.07 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1466  molybdenum-pterin binding  38.1 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0340252  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  45.31 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1613  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 277 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000103656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1667  TOBE domain-containing protein  38.1 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000784196  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1487  TOBE domain-containing protein  38.1 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  40.91 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2490  molybdenum-pterin binding protein  38.1 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 268 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1839  molybdenum-pterin binding protein  35.71 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  43.08 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  44.26 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  41.54 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  39.39 
 
 		 69 aa  42  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  46.15 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  42.42 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  44.68 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  41.1 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  39.39 
 
 		 267 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0054  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  36.67 
 
 		 282 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  39.68 
 
 		 71 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1646  TOBE domain-containing protein  38.1 
 
 		 71 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285785  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  40.91 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  32.26 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1236  molybdenum-pterin binding protein, putative  38.1 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  36.67 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1993  molybdenum-pterin binding protein  38.1 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  36.67 
 
 		 282 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2498  molybdenum-pterin binding protein, putative  38.1 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 201 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  36.67 
 
 		 282 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1722  putative molybdenum-pterin binding protein  38.1 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  36.67 
 
 		 282 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0379  putative molybdenum-pterin binding protein  38.1 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0391614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1824  molybdenum-pterin binding protein  38.1 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  36.67 
 
 		 282 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  36.67 
 
 		 282 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  36.67 
 
 		 282 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0782  putative molybdenum-pterin binding protein  38.1 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4319  TOBE domain-containing protein  28.92 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1218  TOBE domain protein  30.65 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.187717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  31.58 
 
 		 209 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1281  TOBE domain protein  30.65 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.238328  normal  0.240101 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  33.87 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  36.51 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1747  TOBE domain protein  36.51 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  64.29 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  64.29 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  64.29 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  64.29 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  35.38 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 279 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  40.43 
 
 		 201 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  35.48 
 
 		 378 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>