142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2691 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  100 
 
 
127 aa  247  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  79.03 
 
 
136 aa  193  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  73.39 
 
 
132 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  69.35 
 
 
133 aa  154  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  70.87 
 
 
141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  67.72 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  60.63 
 
 
135 aa  144  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  63.2 
 
 
131 aa  140  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  62.4 
 
 
132 aa  140  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  64.52 
 
 
163 aa  140  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  60.8 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  60.16 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  60.63 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  58.27 
 
 
135 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  56.69 
 
 
135 aa  133  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  56 
 
 
132 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  56.69 
 
 
134 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  56.69 
 
 
134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  56.69 
 
 
134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  52.42 
 
 
133 aa  130  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  57.03 
 
 
133 aa  128  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  55.12 
 
 
145 aa  128  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  57.48 
 
 
133 aa  127  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  55.2 
 
 
136 aa  122  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  54.76 
 
 
136 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  58.73 
 
 
134 aa  120  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  56.76 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  55.56 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  59.52 
 
 
140 aa  106  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  48.78 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  51.61 
 
 
72 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  28.68 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  29.19 
 
 
270 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  45.45 
 
 
452 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  39.06 
 
 
195 aa  50.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 
353 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0054  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.97 
 
 
361 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  41.27 
 
 
281 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  42.86 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0114044 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  40 
 
 
68 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  44.64 
 
 
59 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  37.35 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
266 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  42.86 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  45.31 
 
 
374 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  38.71 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  33.85 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1572  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 
363 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00359628 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  31.87 
 
 
263 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  46.03 
 
 
361 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  35.94 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  36.92 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  38.1 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  37.1 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1281  TOBE domain protein  35.94 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.238328  normal  0.240101 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  39.06 
 
 
378 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  42.19 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  35.38 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  35.71 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1218  TOBE domain protein  35.94 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.187717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1839  molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  42.59 
 
 
205 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  41.27 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 
269 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  28.04 
 
 
192 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  54.05 
 
 
206 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1236  molybdenum-pterin binding protein, putative  41.54 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1993  molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2498  molybdenum-pterin binding protein, putative  41.54 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1085  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252098  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1565  molybdenum-pterin binding  40 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.239605  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2790  TOBE domain-containing protein  40.3 
 
 
438 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1722  putative molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0379  putative molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0391614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1824  molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0782  putative molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
276 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1541  TOBE domain-containing protein  40 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00697531  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  38.1 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2490  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1466  molybdenum-pterin binding  40 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0340252  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
279 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  39.68 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  35.94 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  35.23 
 
 
269 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1667  TOBE domain-containing protein  40 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000784196  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1487  TOBE domain-containing protein  40 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  42.86 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1747  TOBE domain protein  37.14 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  34.29 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  39.34 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  35.38 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  34.29 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  35.38 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  41.27 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3517  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  45.16 
 
 
380 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3714  response regulator receiver protein  48.94 
 
 
207 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  34.92 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1646  TOBE domain-containing protein  40 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285785  normal  0.27143 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>