More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0054 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0054  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
361 aa  706    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0998  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  54.42 
 
 
364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1572  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  53.46 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00359628 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1056  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  53.59 
 
 
364 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1059  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  52.49 
 
 
364 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.866194  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  38.46 
 
 
380 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  38.64 
 
 
380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  37.46 
 
 
380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.34 
 
 
359 aa  233  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1878  molybdate ABC transporter ATPase  38.89 
 
 
357 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 
355 aa  229  8e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  37.01 
 
 
348 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  37 
 
 
347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  43.77 
 
 
349 aa  222  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  44.35 
 
 
361 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  46.73 
 
 
385 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2943  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  38.35 
 
 
359 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  46.45 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2758  ABC transporter:TOBE  38.52 
 
 
362 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394387  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  38.46 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  43.79 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  43.36 
 
 
358 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  43.36 
 
 
358 aa  212  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2975  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 
362 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469228  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40 
 
 
352 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  40.6 
 
 
351 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  42.07 
 
 
355 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  51.6 
 
 
358 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  44.89 
 
 
330 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  39.84 
 
 
356 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  45.26 
 
 
364 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3429  molybdenum transporter  39.23 
 
 
361 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  46.26 
 
 
350 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  41.84 
 
 
349 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40420  molybdenum transport protein ModC  39.23 
 
 
361 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  39.32 
 
 
357 aa  206  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  48.64 
 
 
355 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.87 
 
 
355 aa  205  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  42.55 
 
 
353 aa  205  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  35.99 
 
 
386 aa  205  9e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  38.07 
 
 
366 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  40.72 
 
 
365 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
604 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  42.65 
 
 
354 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.18 
 
 
349 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.02 
 
 
370 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
352 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  47.29 
 
 
356 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  41.84 
 
 
349 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  44.52 
 
 
352 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  43.81 
 
 
343 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  40 
 
 
366 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  41.69 
 
 
349 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  40.65 
 
 
366 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4534  ABC transporter related  38.46 
 
 
365 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.24 
 
 
353 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 
318 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 
318 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
330 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  47.15 
 
 
330 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  41.69 
 
 
349 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  41.36 
 
 
349 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
330 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.51 
 
 
604 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  39.7 
 
 
380 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  40.36 
 
 
387 aa  202  5e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  41.36 
 
 
349 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 
359 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  38.72 
 
 
365 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  46.59 
 
 
370 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  43.33 
 
 
342 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  38.3 
 
 
353 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  50.68 
 
 
347 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  46.57 
 
 
350 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  44.07 
 
 
353 aa  202  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.09 
 
 
379 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.65 
 
 
381 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  43.75 
 
 
352 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  44.22 
 
 
349 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  37.46 
 
 
366 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  41.04 
 
 
338 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  43.42 
 
 
352 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42 
 
 
356 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  43.82 
 
 
349 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  44.36 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.88 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0649  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.12 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.46 
 
 
615 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  44.22 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  44.4 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  43.29 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  44.57 
 
 
352 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.51 
 
 
373 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  43.75 
 
 
356 aa  200  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.29 
 
 
372 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  42.04 
 
 
386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>