207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1337 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1337  TOBE domain-containing protein  100 
 
 		 74 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0612  TOBE domain protein  90.54 
 
 		 74 aa  130  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  68.18 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  65.15 
 
 		 69 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  65.15 
 
 		 69 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  62.12 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  62.12 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  62.12 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  61.19 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  61.19 
 
 		 67 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1743  TOBE domain-containing protein  60.61 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  59.7 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  59.7 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  60.61 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  57.58 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5517  TOBE domain protein  57.58 
 
 		 69 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520442  normal  0.766178 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  61.54 
 
 		 69 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  61.54 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  56.72 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  56.72 
 
 		 69 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3573  TOBE domain-containing protein  62.12 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114567  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0609  TOBE domain protein  52.24 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00563993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  59.09 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  50.75 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  50 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  47.14 
 
 		 260 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.27 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  46.27 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  43.94 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  43.94 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  43.94 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  43.94 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2490  molybdenum-pterin binding  43.08 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.17041  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2558  molybdenum-pterin binding protein  43.08 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127714  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 268 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  50 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  45.31 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  48.57 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1546  TOBE domain-containing protein  43.94 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121614  hitchhiker  0.000827182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.97 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  44.78 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2656  molybdenum-pterin binding  40 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00543737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  43.94 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  42.42 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  45.31 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  50 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3636  TOBE domain-containing protein  40.91 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  43.94 
 
 		 262 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  43.28 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  48.44 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 268 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  43.48 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3108  TOBE domain-containing protein  40.91 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0224442  hitchhiker  0.00000231206 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  46.15 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  40.91 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  42.65 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1530  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.24 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00438409 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  46.97 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  46.38 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  46.97 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 276 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  40.58 
 
 		 269 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  36.49 
 
 		 266 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  44.78 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  45.71 
 
 		 263 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  44.29 
 
 		 262 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  39.71 
 
 		 263 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  44.29 
 
 		 282 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  44.29 
 
 		 263 aa  53.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  47.69 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  44.29 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  44.29 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  44.29 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  44.29 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  44.29 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3442  TOBE domain protein  46.27 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.650149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  35.71 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  40.58 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  41.18 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1548  molybdenum-pterin binding protein  46.27 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.98183  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  38.03 
 
 		 257 aa  52  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 270 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 278 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  46.27 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 274 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  42.86 
 
 		 282 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  40 
 
 		 268 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  37.88 
 
 		 270 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1586  TOBE domain protein  39.39 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0327768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  43.28 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1559  molybdenum-pterin binding protein  40.3 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0856932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  47.69 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 281 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 279 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>