242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5200 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  100 
 
 
69 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  84.06 
 
 
69 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1743  TOBE domain-containing protein  73.91 
 
 
69 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  71.01 
 
 
69 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  68.12 
 
 
69 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  67.65 
 
 
69 aa  90.5  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  65.22 
 
 
69 aa  89.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  66.67 
 
 
69 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  66.18 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  57.97 
 
 
69 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  63.77 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  59.42 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  63.64 
 
 
67 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  63.64 
 
 
67 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  59.42 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  59.42 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  59.42 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5517  TOBE domain protein  62.32 
 
 
69 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520442  normal  0.766178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1337  TOBE domain-containing protein  59.7 
 
 
74 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3573  TOBE domain-containing protein  68.12 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114567  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0612  TOBE domain protein  59.38 
 
 
74 aa  77.4  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0609  TOBE domain protein  52.24 
 
 
68 aa  73.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00563993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  54.41 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  55.88 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  49.28 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  52.24 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  51.52 
 
 
68 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  52.94 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  49.23 
 
 
269 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0274  TOBE domain protein  50.72 
 
 
69 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0234749 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  50.75 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  52.17 
 
 
72 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.38 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  53.62 
 
 
68 aa  63.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  49.28 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
278 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  45.59 
 
 
274 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  49.25 
 
 
278 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  48.48 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1586  TOBE domain protein  47.83 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0327768  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  48.53 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  45.59 
 
 
268 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  47.83 
 
 
270 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  51.47 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  42.42 
 
 
68 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
278 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3942  molybdenum-pterin binding protein  44.93 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
281 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  49.28 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
281 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3636  TOBE domain-containing protein  47.83 
 
 
69 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 
279 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0278  TOBE domain-containing protein  50 
 
 
69 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  47.06 
 
 
177 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 
279 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  50 
 
 
141 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  50 
 
 
263 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  49.25 
 
 
267 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  47.06 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  47.83 
 
 
70 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  48.57 
 
 
263 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  47.83 
 
 
70 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  47.83 
 
 
70 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  43.28 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  47.06 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  48.53 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  48.53 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  47.83 
 
 
70 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  49.25 
 
 
269 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  46.38 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  46.38 
 
 
143 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  44.12 
 
 
270 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  46.38 
 
 
278 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  46.27 
 
 
262 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  46.38 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  43.28 
 
 
269 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  44.78 
 
 
276 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  44.12 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2656  molybdenum-pterin binding  44.93 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00543737  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  46.27 
 
 
262 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  41.79 
 
 
142 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3108  TOBE domain-containing protein  46.38 
 
 
69 aa  58.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0224442  hitchhiker  0.00000231206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  44.12 
 
 
290 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  48.53 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  48.53 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  44.93 
 
 
282 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  45.59 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  44.78 
 
 
263 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  43.48 
 
 
282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  43.48 
 
 
282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  43.48 
 
 
262 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  43.48 
 
 
282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2558  molybdenum-pterin binding protein  44.93 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127714  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  44.12 
 
 
269 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  43.48 
 
 
282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  43.48 
 
 
282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  44.12 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  47.76 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  48.53 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>