151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0609 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0609  TOBE domain protein  100 
 
 		 68 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00563993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  52.24 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  53.03 
 
 		 69 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  54.41 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  58.21 
 
 		 69 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  52.24 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  56.72 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  56.72 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  55.22 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  52.24 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  52.94 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  52.94 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  52.94 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1337  TOBE domain-containing protein  52.24 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  48.48 
 
 		 69 aa  67  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  51.47 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  50.75 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  52.24 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0612  TOBE domain protein  51.52 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5517  TOBE domain protein  50.75 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520442  normal  0.766178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1743  TOBE domain-containing protein  50.75 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  49.25 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  44.78 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  46.27 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3573  TOBE domain-containing protein  49.25 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114567  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  42.42 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  43.28 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  41.54 
 
 		 260 aa  53.9  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  44.78 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  42.65 
 
 		 68 aa  52.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  39.71 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  44.78 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  40 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  40 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  38.46 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  40.3 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 263 aa  50.1  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2490  molybdenum-pterin binding  38.81 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.17041  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2558  molybdenum-pterin binding protein  38.81 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127714  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  38.24 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  41.79 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  35.82 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 270 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 261 aa  48.9  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  38.81 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  36.36 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  37.31 
 
 		 278 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  39.39 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2656  molybdenum-pterin binding  35.82 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00543737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  35.82 
 
 		 378 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1119  ABC transporter solute-binding protein  34.85 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  35.82 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  39.39 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  35.82 
 
 		 266 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  37.88 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  35.82 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  35.82 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  35.82 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 290 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  37.88 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  40.91 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1586  TOBE domain protein  38.81 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0327768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  36.76 
 
 		 262 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 262 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 261 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  38.81 
 
 		 269 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  41.79 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  35.82 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2490  molybdenum-pterin binding protein  39.44 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1436  TOBE domain-containing protein  41.38 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  32.31 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 195 aa  44.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0278  TOBE domain-containing protein  38.46 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 279 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1548  molybdenum-pterin binding protein  35.29 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.98183  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  37.31 
 
 		 265 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  37.31 
 
 		 265 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 278 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  34.33 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 279 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 276 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  34.85 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1559  molybdenum-pterin binding protein  35.82 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0856932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  37.5 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  40.91 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 268 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  39.71 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  39.71 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1747  TOBE domain protein  38.03 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0119  molybdenum-pterin binding protein II  32.86 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.148673  hitchhiker  0.000165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  37.31 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  39.39 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  34.85 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  35.82 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.951599 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>