81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0278 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0278  TOBE domain-containing protein  100 
 
 
69 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1743  TOBE domain-containing protein  52.94 
 
 
69 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  48.53 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  50 
 
 
69 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  45.59 
 
 
69 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  47.06 
 
 
69 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  47.06 
 
 
69 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  45.59 
 
 
69 aa  60.1  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  47.06 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  48.53 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  47.06 
 
 
69 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  47.76 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  47.76 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  44.12 
 
 
69 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  48.44 
 
 
67 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  48.44 
 
 
67 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  46.97 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0209  TOBE domain protein  41.18 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.723905  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1586  TOBE domain protein  42.65 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0327768  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  40.3 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  43.75 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3573  TOBE domain-containing protein  50 
 
 
69 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114567  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1337  TOBE domain-containing protein  44.62 
 
 
74 aa  50.1  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  47.06 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  39.71 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  40.3 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  40 
 
 
269 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  44.12 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  42.65 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  42.65 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.46 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  44.93 
 
 
263 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  43.28 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  44.93 
 
 
263 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5517  TOBE domain protein  42.65 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520442  normal  0.766178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  40 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0612  TOBE domain protein  43.75 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  36.76 
 
 
268 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  39.13 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  37.31 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  39.13 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  43.08 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  39.13 
 
 
141 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.82 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  40.91 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
269 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  38.24 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  39.13 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  35.29 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  39.13 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  37.68 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  38.81 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  38.46 
 
 
270 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  42.19 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0609  TOBE domain protein  38.46 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00563993 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  37.68 
 
 
141 aa  43.9  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  44.12 
 
 
278 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2656  molybdenum-pterin binding  39.71 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00543737  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  35.94 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  38.24 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  36.23 
 
 
141 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  36.92 
 
 
257 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  36.36 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  37.5 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  36.36 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  34.78 
 
 
270 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3636  TOBE domain-containing protein  35.29 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  36.23 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0186  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
355 aa  42  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  35.94 
 
 
67 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  33.82 
 
 
269 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  36.92 
 
 
281 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1546  TOBE domain-containing protein  36.76 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121614  hitchhiker  0.000827182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  40.3 
 
 
276 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  38.24 
 
 
70 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  38.24 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  38.24 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  38.24 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  32.35 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  38.46 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  47.27 
 
 
270 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>