More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0456 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  100 
 
 
647 aa  1296    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  100 
 
 
647 aa  1296    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  100 
 
 
647 aa  1296    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  36.33 
 
 
637 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  35.77 
 
 
637 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  29.31 
 
 
608 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  29.31 
 
 
608 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  29.31 
 
 
608 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  30.37 
 
 
638 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  33.1 
 
 
617 aa  177  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  33.1 
 
 
617 aa  177  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  23.3 
 
 
637 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  23.67 
 
 
630 aa  117  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  23.67 
 
 
630 aa  117  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  23.67 
 
 
630 aa  117  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  23.67 
 
 
630 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  23.67 
 
 
630 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  23.67 
 
 
630 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  23.67 
 
 
630 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  23.82 
 
 
498 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3243  tyrosine recombinase XerC subunit  35.14 
 
 
335 aa  90.5  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  27.42 
 
 
721 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  27.42 
 
 
721 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  25.69 
 
 
491 aa  89.4  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  28.44 
 
 
663 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  27.42 
 
 
737 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  23.12 
 
 
708 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  26.37 
 
 
426 aa  87.8  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  23.36 
 
 
684 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  23.4 
 
 
701 aa  87.4  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  23.9 
 
 
295 aa  83.2  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1455  integrase family protein  34.8 
 
 
365 aa  83.2  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0131  integrase family protein  35.59 
 
 
312 aa  82  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.144823 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  26.38 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  26.38 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 
295 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  22.52 
 
 
675 aa  79.3  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.16 
 
 
302 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.38 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.54 
 
 
306 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.8 
 
 
311 aa  79  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  28.36 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  31.8 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.36 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  32.57 
 
 
337 aa  77  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  26.82 
 
 
292 aa  77  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.63 
 
 
300 aa  75.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  28.53 
 
 
298 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  30.84 
 
 
292 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  29.38 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.91 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  27.55 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  26.09 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  27.8 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.53 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  26.21 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.75 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.09 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1743  Phage integrase  28.78 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3433  phage integrase family protein  33.49 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  23.68 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.47 
 
 
310 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.47 
 
 
310 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.47 
 
 
310 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 
301 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  31.75 
 
 
360 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.47 
 
 
310 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.47 
 
 
310 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.47 
 
 
310 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 
302 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.47 
 
 
310 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.78 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  28.78 
 
 
298 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.78 
 
 
298 aa  72.8  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  33.05 
 
 
313 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.69 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  25.32 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  25.32 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  28.78 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.78 
 
 
298 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.78 
 
 
298 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.78 
 
 
298 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.78 
 
 
298 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.76 
 
 
299 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3973  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.08 
 
 
311 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.556004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.5 
 
 
300 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.5 
 
 
300 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  31.61 
 
 
395 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  27.64 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  25.66 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  25.23 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.5 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.5 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  26.44 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.5 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4076  phage integrase  28.31 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.79 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  27.27 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  27.56 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>