More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2006 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  100 
 
 		 403 aa  820    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  100 
 
 		 403 aa  820    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  100 
 
 		 403 aa  820    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  78.05 
 
 		 403 aa  631  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  74.31 
 
 		 403 aa  623  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5406  phage integrase family protein  59.23 
 
 		 381 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  39.8 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  40.06 
 
 		 304 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1271  phage integrase  39.37 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896321  normal  0.0119714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  32.34 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  36.34 
 
 		 418 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  36.39 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  37.04 
 
 		 412 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  33.12 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4004  integrase family protein  33.75 
 
 		 508 aa  143  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3698  integrase family protein  33.75 
 
 		 508 aa  143  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  39.08 
 
 		 425 aa  141  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0438  phage integrase  33.23 
 
 		 515 aa  139  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  33.63 
 
 		 414 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  30 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  33.22 
 
 		 419 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  30.74 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  30.74 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4899  integrase family protein  30.69 
 
 		 419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  30.74 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  30.74 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  30.74 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  28.43 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2279  integrase family protein  35.07 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  34.86 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0602  phage integrase family protein  29.64 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  27.1 
 
 		 432 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  27.1 
 
 		 432 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  27.1 
 
 		 432 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  27.1 
 
 		 432 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  32.09 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.18 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.18 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.18 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.18 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.18 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.18 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.18 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  35.93 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4018  phage integrase family protein  32.66 
 
 		 409 aa  106  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  35.06 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.15 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 296 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 		 295 aa  103  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.67 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  28.48 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  30.69 
 
 		 294 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  28.62 
 
 		 295 aa  97.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  37.5 
 
 		 413 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.08 
 
 		 300 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  28.87 
 
 		 310 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  29.9 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  26.84 
 
 		 338 aa  95.1  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 295 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.82 
 
 		 303 aa  93.6  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  30.58 
 
 		 292 aa  93.6  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 		 299 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.61 
 
 		 301 aa  93.2  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  32.69 
 
 		 317 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  29.1 
 
 		 296 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.23 
 
 		 299 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  26.85 
 
 		 298 aa  92.8  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  26.19 
 
 		 300 aa  91.3  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  31.08 
 
 		 310 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  27.46 
 
 		 302 aa  90.1  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  27.21 
 
 		 296 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  30.32 
 
 		 292 aa  90.1  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.66 
 
 		 298 aa  89.7  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  31.67 
 
 		 310 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.24 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  26.51 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  24.75 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.43 
 
 		 313 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  28.72 
 
 		 295 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  24.75 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  26.86 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 299 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  25.81 
 
 		 330 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.51 
 
 		 302 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  26.62 
 
 		 295 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  30.65 
 
 		 301 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  25.42 
 
 		 298 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.94 
 
 		 299 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.1 
 
 		 298 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.1 
 
 		 298 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  29.06 
 
 		 328 aa  86.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  31.2 
 
 		 254 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>