More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2214 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2214  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 		 417 aa  860    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000184093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1436  integrase family protein  27.54 
 
 		 641 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  25.09 
 
 		 413 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  24.05 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2243  integrase family protein  29.35 
 
 		 634 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308356 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  24.05 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  24.05 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  24.05 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  24.05 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  23.72 
 
 		 403 aa  90.1  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3692  integrase family protein  30.39 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  29.09 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  29.09 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  29.09 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  29.09 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  23 
 
 		 325 aa  86.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  24.56 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  24.76 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1333  Integrase  23.02 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1804  Integrase  23.02 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.222465  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0032  Integrase  23.02 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.857579  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4018  phage integrase family protein  22.02 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0312  Integrase  23.02 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0150741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  25.41 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4899  integrase family protein  20.73 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  24.4 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  23.4 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  22.39 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  21.46 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  24.41 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0740  putative integrase  28.39 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.650968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  22.33 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  22.72 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  23.65 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  23.65 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  23.65 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  26.46 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  22.33 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  25.16 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5406  phage integrase family protein  24.59 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197458 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  23.28 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  22.54 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9020  integrase/recombinase  24.1 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  25.62 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  24.13 
 
 		 306 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  23.39 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 		 295 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4004  integrase family protein  25.42 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3698  integrase family protein  25.42 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  21.71 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  25.68 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  23.29 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  24.92 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  23.97 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  22.33 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.49 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.79 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  23.91 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  24.06 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.83 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  22.29 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  23.2 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.04 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.04 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  23 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  24.76 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  21.84 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.73 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.04 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  22.63 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  22.5 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0438  phage integrase  27.22 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  22.5 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.65 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  22.15 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.64 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.64 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  24.64 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  25.85 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  25.27 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  25.51 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  24.01 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  21.92 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.99 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.3 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  23.74 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  21.97 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.18 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  23.22 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  22.38 
 
 		 277 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  23.63 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  23.21 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  24.33 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  26.35 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.48 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.48 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  21.83 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>