More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3619 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3619  phage integrase family protein  100 
 
 		 309 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  53.59 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  38.13 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  34.8 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  36.82 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  34.9 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  35.33 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  33.33 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  36.09 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  31.87 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  27.72 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  28.62 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  42.68 
 
 		 373 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  40.91 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  32.98 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  33.91 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  31.18 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.17 
 
 		 322 aa  99.4  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  34.5 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  32.6 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.41 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  39.01 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  40.91 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  41.4 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  33.96 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  41.94 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  36.4 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  32.13 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  39.68 
 
 		 346 aa  95.5  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  41.56 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  32.37 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  35.64 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  32.48 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  39.88 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1322  integrase family protein  38.46 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  38.86 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  34.59 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.9 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.9 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.9 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.89 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.96 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  38.27 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.31 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  33.57 
 
 		 302 aa  92.4  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 		 296 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 		 296 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 		 296 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.31 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.46 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.31 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  39.52 
 
 		 395 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.71 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  39.35 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.5 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.5 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  40 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.5 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.5 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  32.89 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  40.34 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  31.21 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  33.2 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  31.56 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.3 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  35.35 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  39.61 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  30.5 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.44 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5218  integrase family protein  30.72 
 
 		 326 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  31.49 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  42.24 
 
 		 472 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  29.35 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  30.39 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  35.71 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  40.99 
 
 		 380 aa  89.7  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  34.84 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.71 
 
 		 351 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  38.89 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  40.11 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  27.05 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  32.99 
 
 		 342 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  32.77 
 
 		 343 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  29.72 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  36.02 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  36.36 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  31.2 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.96 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  32.77 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  40.76 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.43 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  37.5 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.45 
 
 		 330 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  37.01 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.88 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  37.42 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>