119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00705 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  99.01 
 
 		 356 aa  619  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  99.01 
 
 		 356 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  98.36 
 
 		 356 aa  616  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  40.2 
 
 		 359 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  39.87 
 
 		 359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  39.53 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  44.17 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  39.2 
 
 		 359 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  40.17 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  33.86 
 
 		 368 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  37.72 
 
 		 376 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  37.72 
 
 		 376 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  37.72 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  37.72 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  37.37 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  33.1 
 
 		 372 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  32.53 
 
 		 372 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  30.77 
 
 		 380 aa  145  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  31.23 
 
 		 375 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  32.5 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  30.18 
 
 		 372 aa  142  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  32.19 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  31.47 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  42.54 
 
 		 228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  30.1 
 
 		 362 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  32.69 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  29.21 
 
 		 394 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  24.67 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  30.51 
 
 		 349 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  25.6 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  22.66 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  22.58 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  28.57 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  28.57 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  28.57 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  27.87 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  28.22 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  27.87 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  28.42 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.87 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  30.57 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  36.36 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  25.35 
 
 		 338 aa  57  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  29.91 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  35.59 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  30.43 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.87 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  25 
 
 		 416 aa  55.8  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.23 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  28.57 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  30.26 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.17 
 
 		 400 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  22.7 
 
 		 359 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  25.18 
 
 		 200 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  24.17 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  22.58 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  24.48 
 
 		 406 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  31.13 
 
 		 360 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.15 
 
 		 414 aa  52.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  26.37 
 
 		 402 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  24.11 
 
 		 566 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  22.03 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.22 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.92 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  29.3 
 
 		 415 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  24.9 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  27.08 
 
 		 413 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  24.11 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  26.88 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.64 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  25.69 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  26.09 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  24.55 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  23.12 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  26.09 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  28.35 
 
 		 396 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  31.63 
 
 		 197 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  23.61 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  23.71 
 
 		 342 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  27.13 
 
 		 401 aa  45.8  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  25.23 
 
 		 405 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  26.62 
 
 		 463 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  24.52 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1905  hypothetical protein  25.81 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.397006  hitchhiker  0.00000424663 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  25.63 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  21.56 
 
 		 421 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01846  hypothetical protein  35.82 
 
 		 153 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1555  phage integrase, putative  26.54 
 
 		 423 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.206278  decreased coverage  0.0000047649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  24.56 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  30.23 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  30.99 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  24.07 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>