57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1426 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 376 aa  788    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  99.73 
 
 		 376 aa  786    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  98.67 
 
 		 376 aa  780    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  99.47 
 
 		 376 aa  783    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  99.47 
 
 		 376 aa  783    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  50.81 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  55.97 
 
 		 311 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  44.97 
 
 		 372 aa  325  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  44.18 
 
 		 372 aa  322  8e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  44.18 
 
 		 372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  51.57 
 
 		 260 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  36.16 
 
 		 394 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  35.89 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  35.09 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  35.09 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  35.09 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  33.42 
 
 		 372 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  34.52 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  33.43 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  34.68 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  34.52 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  34.52 
 
 		 359 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  33.7 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  33.08 
 
 		 385 aa  170  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  37.37 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  34.62 
 
 		 284 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  34.15 
 
 		 362 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  38.57 
 
 		 228 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  41.72 
 
 		 194 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  25.87 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  36.44 
 
 		 122 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  36.44 
 
 		 122 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  61.36 
 
 		 72 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  43.66 
 
 		 119 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  26.57 
 
 		 342 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  25.37 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  28.49 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  24.73 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  29.58 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  29.45 
 
 		 325 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  36.92 
 
 		 335 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  40.43 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  23.46 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  38.33 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 182 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  40.35 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  40.35 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  38.33 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  40.35 
 
 		 339 aa  43.5  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  40.35 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  40.35 
 
 		 339 aa  43.5  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  38.33 
 
 		 339 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  23.87 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  41.82 
 
 		 339 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  24.89 
 
 		 392 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>