163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1275 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  93.81 
 
 		 339 aa  653    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  92.63 
 
 		 339 aa  649    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  89.68 
 
 		 339 aa  638    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  92.92 
 
 		 339 aa  650    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  100 
 
 		 339 aa  698    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  96.76 
 
 		 339 aa  674    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  95.87 
 
 		 339 aa  668    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  94.1 
 
 		 339 aa  657    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  91.15 
 
 		 339 aa  632  1e-180  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  54.94 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  54.94 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  57.69 
 
 		 182 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  39.71 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  40.37 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2649  phage integrase family protein  51.61 
 
 		 160 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01846  hypothetical protein  67 
 
 		 153 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  36.89 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  30.38 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  33.98 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  31.29 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  33.5 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  31.58 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  29.32 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  28.79 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  28.03 
 
 		 339 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  27.46 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  28.63 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  29.45 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  26.52 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  29.79 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  32.98 
 
 		 200 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  28.88 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  27.91 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  26.84 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.88 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  25.08 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  26.26 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  29.95 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  25.6 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  25.21 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  25.3 
 
 		 311 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  32.16 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  31.98 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  31.98 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0057  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.35 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  30.13 
 
 		 197 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1203  hypothetical protein  28.93 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000176468  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  29.09 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  32.16 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 393 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.13 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  31.72 
 
 		 312 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  25.27 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  29.14 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  32.18 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.17 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  28.64 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  28.64 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.83 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  24.22 
 
 		 349 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 451 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  25.5 
 
 		 345 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  24.8 
 
 		 303 aa  49.3  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  24.8 
 
 		 303 aa  49.3  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  25.71 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  27.64 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.18 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.18 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.79 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  30.63 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  28.64 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  32.48 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  28.64 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  29.45 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  30.06 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.53 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.53 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  25.48 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.53 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.53 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  24.42 
 
 		 451 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.53 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.53 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.53 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  24.84 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  28.77 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.21 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  24.42 
 
 		 451 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  25.58 
 
 		 251 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.57 
 
 		 295 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.18 
 
 		 306 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  27.78 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>