34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2577 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  820    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  27.11 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  27.85 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  30.56 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  26.43 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  26.94 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  29.9 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  25.16 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  29.28 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  25.16 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  26.07 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  25.57 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  26.07 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  24.84 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  27.47 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  27.3 
 
 		 312 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  30.66 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  25 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  24.92 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  27.5 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  24.75 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  27.5 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  24.41 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  26.03 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  27.07 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4064  hypothetical protein  38.89 
 
 		 88 aa  49.7  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  24.56 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4065  hypothetical protein  41.46 
 
 		 41 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  20.57 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  22.59 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  23.87 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  29.36 
 
 		 122 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  29.36 
 
 		 122 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>