56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2028 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  100 
 
 
260 aa  544  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  62.89 
 
 
380 aa  341  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  60.85 
 
 
311 aa  338  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  51.57 
 
 
376 aa  287  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  51.57 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  51.57 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  51.18 
 
 
376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  51.18 
 
 
376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  50.97 
 
 
372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  50.19 
 
 
372 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  51.72 
 
 
372 aa  260  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  41.09 
 
 
394 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  40.84 
 
 
368 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  40 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  36.58 
 
 
356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  36.58 
 
 
356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  36.58 
 
 
356 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  37.94 
 
 
372 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  39.76 
 
 
284 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  39.76 
 
 
359 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  39.76 
 
 
359 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  34.5 
 
 
375 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  39.76 
 
 
359 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  37.85 
 
 
362 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  39.37 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  32.48 
 
 
385 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  38.32 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  32.69 
 
 
304 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  37.42 
 
 
194 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  42.37 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  42.37 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  29.36 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  37.62 
 
 
119 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  50 
 
 
54 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  25.94 
 
 
394 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  22.76 
 
 
329 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  24.8 
 
 
342 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  27.54 
 
 
325 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  30.97 
 
 
409 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  30.71 
 
 
411 aa  49.7  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  23.28 
 
 
200 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  23.98 
 
 
349 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.59 
 
 
397 aa  45.4  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  21.86 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  23.87 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  21.86 
 
 
341 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  23.77 
 
 
434 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  31.71 
 
 
339 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  29.5 
 
 
417 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  27.14 
 
 
451 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  37.7 
 
 
339 aa  42.7  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  23.9 
 
 
413 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  27.5 
 
 
451 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  25.12 
 
 
333 aa  42  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  27.5 
 
 
451 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>