55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1650 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  100 
 
 
311 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  78.72 
 
 
380 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  56.31 
 
 
376 aa  348  8e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  55.97 
 
 
376 aa  348  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  55.97 
 
 
376 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  55.63 
 
 
376 aa  345  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  55.63 
 
 
376 aa  345  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  60.85 
 
 
260 aa  338  5.9999999999999996e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  46.23 
 
 
372 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  46.23 
 
 
372 aa  268  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  46.23 
 
 
372 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  40.62 
 
 
394 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  40.61 
 
 
368 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  36.82 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  36.82 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  36.82 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  38.1 
 
 
312 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  38.75 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  37.84 
 
 
284 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  38.46 
 
 
359 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  37.37 
 
 
359 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  38.46 
 
 
359 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  36.01 
 
 
372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  34.59 
 
 
362 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  32.44 
 
 
375 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  32.5 
 
 
304 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  40.19 
 
 
228 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  31.41 
 
 
385 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  35.14 
 
 
194 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  28.7 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  37.8 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  37.8 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  28.92 
 
 
394 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  26.6 
 
 
329 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  37.11 
 
 
119 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  55.77 
 
 
54 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  22.97 
 
 
325 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  58.14 
 
 
72 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  28.66 
 
 
346 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  25.13 
 
 
200 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.88 
 
 
414 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  30.65 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.41 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  26.35 
 
 
339 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  24.69 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  25.28 
 
 
401 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  35.71 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  29.13 
 
 
339 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  29.13 
 
 
339 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  27.5 
 
 
360 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  40.32 
 
 
349 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  27.44 
 
 
396 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  23.66 
 
 
340 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  30.89 
 
 
349 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  23.56 
 
 
338 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>