70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1432 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  97.77 
 
 		 359 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  92.76 
 
 		 359 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  98.05 
 
 		 359 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  100 
 
 		 359 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  95.42 
 
 		 284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  41.4 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  41.11 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  41.11 
 
 		 356 aa  258  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  96.52 
 
 		 119 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  39.87 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  41.5 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  38.11 
 
 		 385 aa  202  9e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  38.64 
 
 		 368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  74.59 
 
 		 122 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  74.59 
 
 		 122 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  36.24 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  35.33 
 
 		 375 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  34.52 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  34.52 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  34.52 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  34.25 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  34.25 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  38.46 
 
 		 311 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  35.03 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  35.29 
 
 		 372 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  33.8 
 
 		 372 aa  156  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  33.93 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  35.53 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  39.37 
 
 		 260 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  31.09 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  40 
 
 		 228 aa  139  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  36.77 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  24.35 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  29.21 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  31.98 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  27.37 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  32.47 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  30.81 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  26.03 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  30.77 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  30.23 
 
 		 339 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  30.77 
 
 		 339 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  30.77 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  30.23 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  26.47 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  30.77 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  26.26 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  20.21 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  22.07 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  22.07 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  22.61 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  25 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  26.39 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.8 
 
 		 344 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4408  hypothetical protein  31.25 
 
 		 347 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.8 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  28.47 
 
 		 197 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  30.77 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  25.41 
 
 		 292 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  29.38 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  27.71 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  28.45 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  23.48 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  24.36 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  30.19 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  22.71 
 
 		 402 aa  43.1  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  21.43 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>