46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2269 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  100 
 
 
372 aa  771    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  63.17 
 
 
372 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  62.63 
 
 
372 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  45.24 
 
 
376 aa  329  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  45.24 
 
 
376 aa  328  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  44.97 
 
 
380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  44.97 
 
 
376 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  44.97 
 
 
376 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  44.97 
 
 
376 aa  325  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  39.25 
 
 
394 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  51.72 
 
 
260 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  46.23 
 
 
311 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  38.52 
 
 
368 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  35.04 
 
 
356 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  33.59 
 
 
372 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  35.04 
 
 
356 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  34.76 
 
 
356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  33.98 
 
 
375 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  33.99 
 
 
359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  33.52 
 
 
359 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  34.54 
 
 
359 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  36.36 
 
 
312 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  31.71 
 
 
385 aa  157  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  33.8 
 
 
359 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  35.37 
 
 
284 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  32.19 
 
 
304 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  30.47 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  38.21 
 
 
228 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  39.19 
 
 
194 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  37.9 
 
 
122 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  37.9 
 
 
122 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  30.66 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  29.24 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  34.86 
 
 
119 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  53.85 
 
 
54 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  29.08 
 
 
325 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  46.67 
 
 
72 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  25.11 
 
 
365 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.41 
 
 
367 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  27.74 
 
 
326 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  27.74 
 
 
251 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  26.67 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  40.43 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  25.2 
 
 
470 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  32.99 
 
 
361 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>