40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1674 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  100 
 
 		 385 aa  790    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  40.21 
 
 		 368 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  35.68 
 
 		 375 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  38.11 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  38.11 
 
 		 359 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  37.67 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  34.96 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  36.86 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  33.85 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  34.13 
 
 		 356 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  33.86 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  33.6 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  33.97 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  33.59 
 
 		 376 aa  176  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  37.07 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  33.33 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  33.08 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  33.08 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  33.08 
 
 		 376 aa  170  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  33.6 
 
 		 362 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  34.36 
 
 		 372 aa  169  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  34.87 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  33.93 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  31.71 
 
 		 372 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  31.47 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  32.48 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  31.41 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  36.16 
 
 		 228 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  34.36 
 
 		 194 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  37.6 
 
 		 122 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  37.6 
 
 		 122 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  25 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  37.61 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  26.96 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 326 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  52.94 
 
 		 54 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  38.46 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  26.82 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 335 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  38.98 
 
 		 72 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>