147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2946 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  100 
 
 		 312 aa  634    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  45.54 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  45.54 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  45.54 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  42.47 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  42.18 
 
 		 359 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  41.78 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  44.17 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  42.45 
 
 		 284 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  41.5 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  39.24 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  38.1 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  40 
 
 		 260 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  34.09 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  43.06 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  34.46 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  35.26 
 
 		 375 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  33.97 
 
 		 385 aa  176  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  35.02 
 
 		 376 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  34.68 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  34.68 
 
 		 376 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  34.34 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  34.34 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  36.36 
 
 		 372 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  34 
 
 		 372 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  34.13 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  31.68 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  29.11 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  41.38 
 
 		 122 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  41.38 
 
 		 122 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  57.14 
 
 		 119 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  54.72 
 
 		 54 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  23.46 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  25.45 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  26.46 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  26.14 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.61 
 
 		 414 aa  62.4  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.34 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  22.44 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.34 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  27.22 
 
 		 443 aa  59.7  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  33.33 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  33.33 
 
 		 339 aa  58.9  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  27.72 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  22.98 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  33.1 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  24.62 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  23.32 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  25.08 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  24.4 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  32.68 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  31.9 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  27.54 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  26.59 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  24.58 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  32.41 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  24.82 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  22.27 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 413 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  27.69 
 
 		 200 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  32.41 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  24.87 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  31.72 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  31.97 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  25.54 
 
 		 292 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  23.4 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  30 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  29.65 
 
 		 406 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  47.17 
 
 		 72 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  24.91 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  31.37 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  22.34 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  25.96 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  23.53 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  25 
 
 		 347 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  25 
 
 		 347 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  23.03 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  22.39 
 
 		 374 aa  49.7  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  26.16 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  23.55 
 
 		 391 aa  49.3  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  24.45 
 
 		 297 aa  49.3  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  23.5 
 
 		 397 aa  49.3  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  21.54 
 
 		 342 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  20.49 
 
 		 393 aa  49.3  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  25.63 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  21.93 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  25.86 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  25.86 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  28.97 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  22.49 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  29.46 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  25.88 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  31.75 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  22.54 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>