35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2069 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  249  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
122 aa  249  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  77.87 
 
 
359 aa  205  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  77.87 
 
 
284 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  75.41 
 
 
359 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  74.59 
 
 
359 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  74.59 
 
 
359 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  74.78 
 
 
119 aa  183  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  40.68 
 
 
375 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  35.09 
 
 
356 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  35.09 
 
 
356 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  35.09 
 
 
356 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  41.38 
 
 
312 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  37.6 
 
 
385 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  42.37 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  37.8 
 
 
311 aa  70.1  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  38.46 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  37.9 
 
 
372 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  34.21 
 
 
228 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  39.32 
 
 
372 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  36.44 
 
 
376 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  39.32 
 
 
372 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  36.44 
 
 
376 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  36.44 
 
 
376 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  36.13 
 
 
368 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  38.26 
 
 
394 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  35.59 
 
 
376 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  35.59 
 
 
376 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  34.21 
 
 
372 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  39.05 
 
 
194 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  52.27 
 
 
54 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  31.62 
 
 
362 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  52.17 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  29.36 
 
 
394 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>