216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1083 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  92.63 
 
 		 339 aa  649    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  100 
 
 		 339 aa  696    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  95.58 
 
 		 339 aa  665    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  89.97 
 
 		 339 aa  627  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  89.97 
 
 		 339 aa  627  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  89.68 
 
 		 339 aa  625  1e-178  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  89.09 
 
 		 339 aa  620  1e-177  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  88.79 
 
 		 339 aa  621  1e-177  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  86.43 
 
 		 339 aa  608  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  55.23 
 
 		 344 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  55.23 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  58.24 
 
 		 182 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  39.13 
 
 		 349 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  39.44 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2649  phage integrase family protein  52.26 
 
 		 160 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01846  hypothetical protein  67 
 
 		 153 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  35.75 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  29.9 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  31.54 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  31.23 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  34.8 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  32.51 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  27.84 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 324 aa  89.7  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  27.73 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  26.78 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  27.35 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  26.38 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  32.92 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  34.57 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  34.04 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  30.89 
 
 		 200 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  25.86 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  24.77 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  26.29 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  27.15 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  27 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  26.89 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  23.44 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  25.91 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  24.68 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  30.41 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0057  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  35.59 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  27.43 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.46 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.25 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  32.47 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  31.13 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  27.6 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  32.47 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  20.72 
 
 		 366 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  29.94 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 451 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  25.41 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  25.97 
 
 		 456 aa  52.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  31.13 
 
 		 284 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4375  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.83 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25.91 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.25 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.86 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1203  hypothetical protein  27.23 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000176468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  31.37 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  28.66 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  25.54 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  28.09 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  28.09 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  28.09 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.24 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  25.93 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  31.25 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  24.04 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.49 
 
 		 310 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.49 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  31.25 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.49 
 
 		 310 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.49 
 
 		 310 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.49 
 
 		 310 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.49 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.49 
 
 		 310 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  27.53 
 
 		 376 aa  49.7  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.02 
 
 		 306 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.02 
 
 		 306 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  30.63 
 
 		 307 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.46 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.26 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.26 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3973  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.38 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.556004  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.26 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  26 
 
 		 304 aa  49.3  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.87 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.02 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  26.21 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  28.93 
 
 		 387 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  26.21 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  30.92 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>