29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01846 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01846  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  298  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  67 
 
 		 339 aa  134  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  67 
 
 		 339 aa  133  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  67.01 
 
 		 339 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  67.01 
 
 		 339 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  67.01 
 
 		 339 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  67.01 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  67.01 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  67.01 
 
 		 339 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  65.98 
 
 		 339 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  53.76 
 
 		 182 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  49.46 
 
 		 344 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  49.46 
 
 		 344 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  41.24 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  35.96 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  37.5 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  32.58 
 
 		 325 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  33.7 
 
 		 346 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  33.33 
 
 		 329 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  37.31 
 
 		 356 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  37.31 
 
 		 356 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  30.99 
 
 		 200 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  35.82 
 
 		 304 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  35.82 
 
 		 356 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  42.31 
 
 		 312 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 338 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  27.78 
 
 		 342 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  31.43 
 
 		 341 aa  41.2  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  31.43 
 
 		 359 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>