129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2832 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  100 
 
 		 344 aa  708    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  98.55 
 
 		 344 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  55.81 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  55.23 
 
 		 339 aa  368  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  54.36 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  54.94 
 
 		 339 aa  364  1e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  54.36 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  54.65 
 
 		 339 aa  362  4e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  54.07 
 
 		 339 aa  360  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  53.78 
 
 		 339 aa  358  5e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  53.78 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  69.78 
 
 		 182 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2649  phage integrase family protein  65.19 
 
 		 160 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  43.12 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  39.14 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  29.41 
 
 		 329 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  30.28 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  31.31 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  29.68 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  30.43 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  29 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  28.3 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  31.37 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  28.28 
 
 		 338 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  30.56 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  28 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01846  hypothetical protein  49.46 
 
 		 153 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  28.46 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  26.81 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  27.04 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  31.58 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  26.71 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  26.49 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  27.99 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  28.94 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  28.34 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  28.69 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  25.68 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  30.77 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  25.24 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  27.52 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  30.89 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  28.51 
 
 		 311 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  26.6 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  28.87 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  27.02 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  23.14 
 
 		 412 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5393  integrase family protein  25.59 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  25.45 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  25.27 
 
 		 456 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  30.37 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  24.92 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 451 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1203  hypothetical protein  25.66 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000176468  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  27.76 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  26.24 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.35 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  29.45 
 
 		 228 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  23.62 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.38 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  24.26 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.82 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 451 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1455  integrase family protein  23.16 
 
 		 365 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.38 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  25.78 
 
 		 375 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  29.53 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  30.7 
 
 		 387 aa  49.7  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.15 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  24.11 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  23.53 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.74 
 
 		 400 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.41 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.41 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  23.38 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  23.11 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  25.11 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  24.2 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  23.68 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  23.68 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  23.53 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.41 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.04 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  29.37 
 
 		 608 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  29.37 
 
 		 608 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  29.37 
 
 		 608 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.04 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.32 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.32 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.32 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 402 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.04 
 
 		 310 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  21.97 
 
 		 421 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>