76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2096 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  100 
 
 		 200 aa  420  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  86.84 
 
 		 329 aa  358  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  60.64 
 
 		 342 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  63.83 
 
 		 359 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  63.83 
 
 		 341 aa  244  8e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  61.14 
 
 		 339 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  49.23 
 
 		 338 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  48.19 
 
 		 338 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  45.41 
 
 		 334 aa  171  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0995  integrase protein  63.85 
 
 		 147 aa  168  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000161367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  47.15 
 
 		 338 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  46.63 
 
 		 338 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  33.88 
 
 		 326 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  32.16 
 
 		 342 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  31.5 
 
 		 325 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  30.52 
 
 		 368 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  33.54 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  31.94 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  31.94 
 
 		 339 aa  77.8  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  31.94 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  32.31 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  31.94 
 
 		 339 aa  75.5  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  32.98 
 
 		 339 aa  75.5  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  31.41 
 
 		 339 aa  74.7  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  31.94 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  28.43 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.58 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  31.96 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  30.89 
 
 		 339 aa  68.6  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  26.2 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0555  hypothetical protein  27.87 
 
 		 371 aa  64.7  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178247  normal  0.46728 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  26.96 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  26.96 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  26.96 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  26.96 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  34.48 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  28.33 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  30.94 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  27.06 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  25.18 
 
 		 304 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  27.69 
 
 		 312 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  26.42 
 
 		 349 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  24.68 
 
 		 373 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01326  site-specific recombinase, phage integrase family  25.81 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0890687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 311 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  26.09 
 
 		 341 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  25.13 
 
 		 380 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  32.63 
 
 		 335 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  27.27 
 
 		 350 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  23.28 
 
 		 260 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 360 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  37.84 
 
 		 319 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  22.8 
 
 		 368 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  25.48 
 
 		 311 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  25.29 
 
 		 344 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  26.14 
 
 		 345 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04071  site-specific recombinase, phage integrase family  22.27 
 
 		 424 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0594853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  25.43 
 
 		 346 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 372 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01846  hypothetical protein  30.99 
 
 		 153 aa  45.1  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 372 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  26.82 
 
 		 359 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  22.95 
 
 		 397 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  24.16 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  27.56 
 
 		 350 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  27.37 
 
 		 375 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  25.68 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 332 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  23.92 
 
 		 331 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  23.92 
 
 		 331 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  23.63 
 
 		 412 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 400 aa  41.2  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  31.82 
 
 		 400 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>